RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598539.5

FCHO1-225, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-225ENST00000598539 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-225ENST00000598539 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-225ENST00000598539 CETPP11597 493 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-225ENST00000598539 MAP3K9P80192 1104 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-225ENST00000598539 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-225ENST00000598539 GCKRQ14397 625 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-225ENST00000598539 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-225ENST00000598539 BRI3BPQ8WY22 251 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-225ENST00000598539 DPF3Q92784 378 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-225ENST00000598539 SERPINA10Q9UK55 444 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-225ENST00000598539 TLR2O60603 784 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 CSF1RP07333 972 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 HOXD10P28358 340 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 OTUD5Q96G74 571 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 SMC4Q9NTJ3 1288 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 PTPRCP08575 1304 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 MYCP01106 439 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 SLC4A2P04920 1241 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 FLIIQ13045 1269 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 TAF7LQ5H9L4 462 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 CHMP3Q9Y3E7 222 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 NR2E3Q9Y5X4 410 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 TAF5LO75529 589 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 SNAPC2Q13487 334 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 VGLL4Q14135 290 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 MFSD14BQ5SR56 506 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 SH3TC2Q8TF17 1288 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 TMOD2Q9NZR1 351 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 SPDYE5A6NIY4 337 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 ERO1BQ86YB8 467 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 FAM43AQ8N2R8 423 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 SLC17A8Q8NDX2 589 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 LINS1Q8NG48 757 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 SSH1Q8WYL5 1049 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 CUL9Q8IWT3 2517 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 BRCA2P51587 3418 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 RARSP54136 660 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 RAET1EQ8TD07 263 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 OTOFQ9HC10 1997 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 IRS2Q9Y4H2 1338 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 TCP10L2B9ZVM9 353 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 CAPN2P17655 700 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 UBXN2AP68543 259 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 DNAAF4Q8WXU2 420 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 TRIM47Q96LD4 638 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 CNNM1Q9NRU3 951 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-225ENST00000598539 A0A1W2PPC1 479 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 CAP1Q01518 475 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 DCAF15Q66K64 600 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 TEPSINQ96N21 525 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM39BQ9GZU3 492 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 JAG2Q9Y219 1238 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 SNAP23O00161 211 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 PLIN1O60240 522 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 GRK4P32298 578 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 CRKP46108 304 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 CASP7P55210 303 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 PPIL2Q13356 520 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 VPS37DQ86XT2 251 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 WRNIP1Q96S55 665 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 SRRDQ9UH36 339 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 BTBD19C9JJ37 291 aa16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 GJB1P08034 283 aa16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 GJA8P48165 433 aa16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 UBE4AQ14139 1066 aa16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 PSMC4P43686 418 aa16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 PPATQ06203 517 aa16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 TEKT1Q969V4 418 aa16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 RNF208Q9H0X6 261 aa16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 RCAN3Q9UKA8 241 aa16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-225ENST00000598539 MAST3O60307 1309 aa16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms