RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595343.5

PDE4C-208, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4C, Length 420 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-208ENST00000595343 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.52■■□□□ 1.36
PDE4C-208ENST00000595343 CRKP46108 304 aa23.52■■□□□ 1.36
PDE4C-208ENST00000595343 SP3Q02447 781 aa23.52■■□□□ 1.36
PDE4C-208ENST00000595343 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PDE4C-208ENST00000595343 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.52■■□□□ 1.36
PDE4C-208ENST00000595343 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.52■■□□□ 1.36
PDE4C-208ENST00000595343 EFCC1Q9HA90 598 aa23.52■■□□□ 1.36
PDE4C-208ENST00000595343 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.52■■□□□ 1.36
PDE4C-208ENST00000595343 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.51■■□□□ 1.35
PDE4C-208ENST00000595343 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PDE4C-208ENST00000595343 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.51■■□□□ 1.35
PDE4C-208ENST00000595343 CAP1Q01518 475 aa23.5■■□□□ 1.35
PDE4C-208ENST00000595343 GRIK5Q16478 980 aa23.5■■□□□ 1.35
PDE4C-208ENST00000595343 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.5■■□□□ 1.35
PDE4C-208ENST00000595343 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.5■■□□□ 1.35
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PDE4C-208ENST00000595343 TNNI2P48788 182 aa23.49■■□□□ 1.35
PDE4C-208ENST00000595343 MAP3K9P80192 1104 aa23.49■■□□□ 1.35
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PDE4C-208ENST00000595343 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.49■■□□□ 1.35
PDE4C-208ENST00000595343 ARMC5Q96C12 935 aa23.49■■□□□ 1.35
PDE4C-208ENST00000595343 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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PDE4C-208ENST00000595343 ANP32CO43423 234 aa23.48■■□□□ 1.35
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PDE4C-208ENST00000595343 CCL15Q16663 113 aa23.47■■□□□ 1.35
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PDE4C-208ENST00000595343 CENPFP49454 3210 aa23.47■■□□□ 1.35
PDE4C-208ENST00000595343 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PDE4C-208ENST00000595343 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.46■■□□□ 1.35
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PDE4C-208ENST00000595343 GCC1Q96CN9 775 aa23.46■■□□□ 1.35
PDE4C-208ENST00000595343 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.46■■□□□ 1.35
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PDE4C-208ENST00000595343 OTUD5Q96G74 571 aa23.45■■□□□ 1.34
PDE4C-208ENST00000595343 CACNB3P54284 484 aa23.44■■□□□ 1.34
PDE4C-208ENST00000595343 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.44■■□□□ 1.34
PDE4C-208ENST00000595343 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.44■■□□□ 1.34
PDE4C-208ENST00000595343 TEKT1Q969V4 418 aa23.44■■□□□ 1.34
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PDE4C-208ENST00000595343 TMEM106CQ9BVX2 250 aa23.41■■□□□ 1.34
PDE4C-208ENST00000595343 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.41■■□□□ 1.34
PDE4C-208ENST00000595343 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.41■■□□□ 1.34
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PDE4C-208ENST00000595343 FAM83AQ86UY5 434 aa23.4■■□□□ 1.34
PDE4C-208ENST00000595343 ERO1BQ86YB8 467 aa23.4■■□□□ 1.34
PDE4C-208ENST00000595343 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PDE4C-208ENST00000595343 WRNIP1Q96S55 665 aa23.4■■□□□ 1.34
PDE4C-208ENST00000595343 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.4■■□□□ 1.34
PDE4C-208ENST00000595343 CETPP11597 493 aa23.39■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.39■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.39■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.39■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 BRCA2P51587 3418 aa23.39■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 MAST3O60307 1309 aa23.38■■□□□ 1.33
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PDE4C-208ENST00000595343 FGFR2P21802 821 aa23.38■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 NBPF11Q86T75 865 aa23.38■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 HOOK2Q96ED9 719 aa23.38■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 ZNF521Q96K83 1311 aa23.37■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 KIF16BQ96L93 1317 aa23.37■■□□□ 1.33
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PDE4C-208ENST00000595343 IRF6O14896 467 aa23.37■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 TLR2O60603 784 aa23.37■■□□□ 1.33
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PDE4C-208ENST00000595343 SNAPC2Q13487 334 aa23.37■■□□□ 1.33
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PDE4C-208ENST00000595343 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 PTPRCP08575 1304 aa23.36■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 USP44Q9H0E7 712 aa23.36■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 PPIL2Q13356 520 aa23.35■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 DCAF15Q66K64 600 aa23.35■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.35■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PDE4C-208ENST00000595343 KIF22Q14807 665 aa23.34■■□□□ 1.33
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