RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593111.1

PSME3-216, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene PSME3, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-216ENST00000593111 CRKP46108 304 aa22.04■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 TNNI2P48788 182 aa22.04■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.04■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.04■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.04■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 POTEFA5A3E0 1075 aa22.03■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 MAP3K9P80192 1104 aa22.03■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.03■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 KAZALD1Q96I82 304 aa22.03■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 TEPSINQ96N21 525 aa22.03■■□□□ 1.12
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PSME3-216ENST00000593111 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.02■■□□□ 1.12
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PSME3-216ENST00000593111 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.02■■□□□ 1.12
PSME3-216ENST00000593111 CSADQ9Y600 493 aa22.02■■□□□ 1.12
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PSME3-216ENST00000593111 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.01■■□□□ 1.11
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PSME3-216ENST00000593111 VGLL4Q14135 290 aa22■■□□□ 1.11
PSME3-216ENST00000593111 CCL15Q16663 113 aa22■■□□□ 1.11
PSME3-216ENST00000593111 LRRC24Q50LG9 513 aa22■■□□□ 1.11
PSME3-216ENST00000593111 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22■■□□□ 1.11
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PSME3-216ENST00000593111 OTUD5Q96G74 571 aa21.99■■□□□ 1.11
PSME3-216ENST00000593111 HTTP42858 3142 aa21.99■■□□□ 1.11
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PSME3-216ENST00000593111 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
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PSME3-216ENST00000593111 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.97■■□□□ 1.11
PSME3-216ENST00000593111 OTOFQ9HC10 1997 aa21.96■■□□□ 1.11
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PSME3-216ENST00000593111 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.96■■□□□ 1.11
PSME3-216ENST00000593111 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.95■■□□□ 1.1
PSME3-216ENST00000593111 CENPFP49454 3210 aa21.95■■□□□ 1.1
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PSME3-216ENST00000593111 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
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PSME3-216ENST00000593111 FAM83AQ86UY5 434 aa21.92■■□□□ 1.1
PSME3-216ENST00000593111 ERO1BQ86YB8 467 aa21.92■■□□□ 1.1
PSME3-216ENST00000593111 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.92■■□□□ 1.1
PSME3-216ENST00000593111 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.92■■□□□ 1.1
PSME3-216ENST00000593111 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
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PSME3-216ENST00000593111 ZNF333Q96JL9 665 aa21.91■■□□□ 1.1
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PSME3-216ENST00000593111 SNAPC2Q13487 334 aa21.9■■□□□ 1.1
PSME3-216ENST00000593111 KIF22Q14807 665 aa21.9■■□□□ 1.1
PSME3-216ENST00000593111 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.9■■□□□ 1.1
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PSME3-216ENST00000593111 USP44Q9H0E7 712 aa21.9■■□□□ 1.1
PSME3-216ENST00000593111 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.9■■□□□ 1.1
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PSME3-216ENST00000593111 TLR2O60603 784 aa21.89■■□□□ 1.09
PSME3-216ENST00000593111 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
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PSME3-216ENST00000593111 FGFR2P21802 821 aa21.88■■□□□ 1.09
PSME3-216ENST00000593111 PPIL2Q13356 520 aa21.88■■□□□ 1.09
PSME3-216ENST00000593111 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.88■■□□□ 1.09
PSME3-216ENST00000593111 EYA2O00167 538 aa21.87■■□□□ 1.09
PSME3-216ENST00000593111 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PSME3-216ENST00000593111 SLC5A1P13866 664 aa21.87■■□□□ 1.09
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