RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 ITGA6P23229 1130 aa30.45■■■□□ 2.47
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CAPNS1-204ENST00000587718 TRPM7Q96QT4 1865 aa30.45■■■□□ 2.47
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CAPNS1-204ENST00000587718 RNF20Q5VTR2 975 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 FSD1Q9BTV5 496 aa30.3■■■□□ 2.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZDHHC9Q9Y397 364 aa30.3■■■□□ 2.44
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