RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587429.1

PKN1-210, Transcript of protein kinase N1, humanhuman

TSL 4

Gene PKN1, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1-210ENST00000587429 COPRSQ9NQ92 184 aa26.93■■□□□ 1.9
PKN1-210ENST00000587429 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PKN1-210ENST00000587429 TRPA1O75762 1119 aa26.92■■□□□ 1.9
PKN1-210ENST00000587429 IL15P40933 162 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PKN1-210ENST00000587429 RASA3Q14644 834 aa26.92■■□□□ 1.9
PKN1-210ENST00000587429 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.92■■□□□ 1.9
PKN1-210ENST00000587429 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PKN1-210ENST00000587429 RNF186Q9NXI6 227 aa26.92■■□□□ 1.9
PKN1-210ENST00000587429 SSC5DA1L4H1 1573 aa26.92■■□□□ 1.9
PKN1-210ENST00000587429 SRGAP3O43295 1099 aa26.91■■□□□ 1.9
PKN1-210ENST00000587429 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PKN1-210ENST00000587429 LDLRAD1Q5T700 205 aa26.91■■□□□ 1.9
PKN1-210ENST00000587429 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.91■■□□□ 1.9
PKN1-210ENST00000587429 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.9■■□□□ 1.9
PKN1-210ENST00000587429 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.9■■□□□ 1.9
PKN1-210ENST00000587429 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PKN1-210ENST00000587429 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.88■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 ADORA1P30542 326 aa26.88■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 MTX1Q13505 466 aa26.88■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.88■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 GNAI2P04899 355 aa26.87■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 PHKA1P46020 1223 aa26.87■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.87■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 TEKT1Q969V4 418 aa26.87■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 SAGE1Q9NXZ1 904 aa26.87■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 TIMM10P62072 90 aa26.86■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 MAP3K11Q16584 847 aa26.86■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 CLMNQ96JQ2 1002 aa26.86■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.86■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 USP2O75604 605 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 CACNB3P54284 484 aa26.85■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 TFCP2Q12800 502 aa26.85■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 TNFAIP1Q13829 316 aa26.85■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 WDR66Q8TBY9 1149 aa26.85■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 TEPSINQ96N21 525 aa26.85■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 MRIQ9BWK5 157 aa26.85■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.85■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.85■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.84■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 SLC10A4Q96EP9 437 aa26.84■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 ABHD8Q96I13 439 aa26.84■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 ZDHHC15Q96MV8 337 aa26.84■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 SPRYD7Q5W111 196 aa26.83■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
PKN1-210ENST00000587429 RLBP1P12271 317 aa26.82■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 TM4SF4P48230 202 aa26.82■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 CCDC102BQ68D86 513 aa26.82■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 HHIPL2Q6UWX4 724 aa26.81■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 MAST3O60307 1309 aa26.81■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 A0A1B0GUL7 405 aa26.8■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 PRDX5P30044 214 aa26.8■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 DIXDC1Q155Q3 683 aa26.8■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 TBC1D8O95759 1140 aa26.79■■□□□ 1.88
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PKN1-210ENST00000587429 MCOLN1Q9GZU1 580 aa26.79■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.79■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 DENND2AQ9ULE3 1009 aa26.79■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 WNK4Q96J92 1243 aa26.78■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.78■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa26.78■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 OTOFQ9HC10 1997 aa26.78■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 SEMA3EO15041 775 aa26.77■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 LDHBP07195 334 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 DGKZQ13574 1117 aa26.77■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 RASGRF1Q13972 1273 aa26.77■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 NEUROD6Q96NK8 337 aa26.77■■□□□ 1.88
PKN1-210ENST00000587429 GJA5P36382 358 aa26.76■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.76■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa26.76■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.76■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 MYH2Q9UKX2 1941 aa26.75■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 SALL1Q9NSC2 1324 aa26.75■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 UNCXA6NJT0 531 aa26.75■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 SREBF2Q12772 1141 aa26.75■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 ATP8B2P98198 1209 aa26.74■■□□□ 1.87
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PKN1-210ENST00000587429 FKBP1CQ5VVH2 108 aa26.74■■□□□ 1.87
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PKN1-210ENST00000587429 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 FAM83AQ86UY5 434 aa26.74■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa26.74■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 ELP3Q9H9T3 547 aa26.74■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 AK9Q5TCS8 1911 aa26.73■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 ZBTB22O15209 634 aa26.73■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 PANK1Q8TE04 598 aa26.72■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 SSH3Q8TE77 659 aa26.72■■□□□ 1.87
PKN1-210ENST00000587429 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.72■■□□□ 1.87
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