RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585934.1

TRAPPC6A-202, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-202ENST00000585934 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.25■□□□□ 0.83
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TRAPPC6A-202ENST00000585934 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC6A-202ENST00000585934 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.25■□□□□ 0.83
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TRAPPC6A-202ENST00000585934 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CA12O43570 354 aa20.24■□□□□ 0.83
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TRAPPC6A-202ENST00000585934 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.16■□□□□ 0.82
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TRAPPC6A-202ENST00000585934 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.16■□□□□ 0.82
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TRAPPC6A-202ENST00000585934 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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TRAPPC6A-202ENST00000585934 ZBTB22O15209 634 aa20.14■□□□□ 0.81
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TRAPPC6A-202ENST00000585934 CAPN15O75808 1086 aa20.13■□□□□ 0.81
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TRAPPC6A-202ENST00000585934 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TEPSINQ96N21 525 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6A-202ENST00000585934 RNF186Q9NXI6 227 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC6A-202ENST00000585934 LAMB1P07942 1786 aa20.13■□□□□ 0.81
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TRAPPC6A-202ENST00000585934 SREBF2Q12772 1141 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6A-202ENST00000585934 FAM83AQ86UY5 434 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6A-202ENST00000585934 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6A-202ENST00000585934 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC6A-202ENST00000585934 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6A-202ENST00000585934 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
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