RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 KRBA2Q6ZNG9 492 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 FAM160A1Q05DH4 1040 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 CNGA4Q8IV77 575 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 IQUBQ8NA54 791 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 ZFYVE9O95405 1425 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 ABCC1P33527 1531 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 NAA25Q14CX7 972 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 SMIM23A6NLE4 172 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 TSGA10Q9BZW7 698 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 CTNND2Q9UQB3 1225 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 TTC14Q96N46 770 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 ATP2A1O14983 1001 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 ZEB2O60315 1214 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 GTF3C6Q969F1 213 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 HDXQ7Z353 690 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 SIRT1Q96EB6 747 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 VWA3AA6NCI4 1184 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 VAV2P52735 878 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF174Q15697 407 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 IMPG2Q9BZV3 1241 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 GNA11P29992 359 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC122Q5T0U0 273 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 PPP2R3AQ06190 1150 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 NPATQ14207 1427 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 SLC27A2O14975 620 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1B0GUA9 196 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 TNNC1P63316 161 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP57Q96MR6 1250 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 PLCB3Q01970 1234 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC63Q8NA47 563 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 EVCP57679 992 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 TESK2Q96S53 571 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 SEPT6Q14141 434 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRM-211ENST00000580170 CPLX4Q7Z7G2 160 aa24.02■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 FAM76AQ8TAV0 307 aa24.02■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 EYA1Q99502 592 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 PLS1Q14651 629 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 NYXQ9GZU5 481 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PP64 1363 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB16Q05516 673 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 SNX14Q9Y5W7 946 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 MBD4O95243 580 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 TLDC2A0PJX2 215 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 RAPGEF1Q13905 1077 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 G2E3Q7L622 706 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 ERO1AQ96HE7 468 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R7Q15435 360 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC25Q86WR0 208 aa24■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.435e-6■□□□□ 9.7
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PTPRM-211ENST00000580170 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 TTC16Q8NEE8 873 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC45Q96CN5 670 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 TCHPQ9BT92 498 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 CLSTN2Q9H4D0 955 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 TUBBP07437 444 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 SV2BQ7L1I2 683 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 PLCH2O75038 1416 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF354CQ86Y25 554 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 PLCG2P16885 1265 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 DPH6Q7L8W6 267 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP58Q5T655 872 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 KCNK9Q9NPC2 374 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 FAM212AQ96EL1 285 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 SMC6Q96SB8 1091 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 ANO1Q5XXA6 986 aa23.98■■□□□ 1.43
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