RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-211ENST00000568586 MOB2Q70IA6 237 aa36.47■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 UBE2Q2LH0YL09 131 aa36.45■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 SEMA3EO15041 775 aa36.45■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 LBX1P52954 281 aa36.45■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 POLA2Q14181 598 aa36.45■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
RAB40C-211ENST00000568586 RASAL3Q86YV0 1011 aa36.44■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 AKAP2Q9Y2D5 859 aa36.44■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 MAST3O60307 1309 aa36.43■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 TFCP2Q12800 502 aa36.43■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 LDLRAD1Q5T700 205 aa36.43■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 ZDHHC15Q96MV8 337 aa36.43■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 VEZTQ9HBM0 779 aa36.43■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 ADORA1P30542 326 aa36.42■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 PHKA1P46020 1223 aa36.42■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 TIMM10P62072 90 aa36.42■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 ATP8B2P98198 1209 aa36.42■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 MAP3K11Q16584 847 aa36.42■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 ITPRIPQ8IWB1 547 aa36.42■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 SSH3Q8TE77 659 aa36.42■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 TEKT1Q969V4 418 aa36.42■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 SALL1Q9NSC2 1324 aa36.41■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 TNFAIP1Q13829 316 aa36.41■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 RASA3Q14644 834 aa36.41■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 CCDC102BQ68D86 513 aa36.41■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 HHIPL2Q6UWX4 724 aa36.41■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 ARMC9Q7Z3E5 817 aa36.41■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 DENND2AQ9ULE3 1009 aa36.41■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 SSC5DA1L4H1 1573 aa36.4■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 A0A1B0GUL7 405 aa36.4■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa36.4■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
RAB40C-211ENST00000568586 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 TNS4Q8IZW8 715 aa36.38■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 UNCXA6NJT0 531 aa36.37■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP36.37■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 XAGE2Q96GT9 111 aa36.37■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 CSRNP1Q96S65 589 aa36.37■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 MYH13Q9UKX3 1938 aa36.37■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 MS4A1P11836 297 aa36.36■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 MVPQ14764 893 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 FKBP1CQ5VVH2 108 aa36.35■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 PANK1Q8TE04 598 aa36.35■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 TEPSINQ96N21 525 aa36.35■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 SAGE1Q9NXZ1 904 aa36.34■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 RASGRF1Q13972 1273 aa36.33■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 C1orf115Q9H7X2 142 aa36.33■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
RAB40C-211ENST00000568586 PRDX5P30044 214 aa36.32■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 PRKG1Q13976 671 aa36.32■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 GPR108Q9NPR9 543 aa36.32■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 TNNI2P48788 182 aa36.31■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 RCAN3Q9UKA8 241 aa36.31■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 LDHBP07195 334 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 FAM83AQ86UY5 434 aa36.3■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 FZD1Q9UP38 647 aa36.3■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 TCP10L2B9ZVM9 353 aa36.29■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 USP2O75604 605 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 TSKSQ9UJT2 592 aa36.29■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa36.29■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 NEUROD6Q96NK8 337 aa36.28■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 TMEM39BQ9GZU3 492 aa36.28■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 RNF186Q9NXI6 227 aa36.28■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 CEP85Q6P2H3 762 aa36.27■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 SURF6O75683 361 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 TM4SF4P48230 202 aa36.26■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 DIXDC1Q155Q3 683 aa36.26■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 CDAN1Q8IWY9 1227 aa36.26■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 TMOD2Q9NZR1 351 aa36.26■■■■□ 3.4
RAB40C-211ENST00000568586 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 IREB2P48200 963 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 SPRYD7Q5W111 196 aa36.25■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 CACNB3P54284 484 aa36.24■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 SLC10A4Q96EP9 437 aa36.24■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 HMG20BQ9P0W2 317 aa36.23■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 TNNI3KQ59H18 835 aa36.22■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa36.22■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 CLMNQ96JQ2 1002 aa36.22■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa36.22■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 GAKO14976 1311 aa36.22■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 TRPA1O75762 1119 aa36.21■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 GORABQ5T7V8 394 aa36.21■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa36.21■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 AKAP11Q9UKA4 1901 aa36.21■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 DDX19BQ9UMR2 479 aa36.21■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
RAB40C-211ENST00000568586 SPATA5Q8NB90 893 aa36.2■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms