RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568443.2

CLN3-232, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-232ENST00000568443 RASA3Q14644 834 aa28■■■□□ 2.07
CLN3-232ENST00000568443 GRIK5Q16478 980 aa28■■■□□ 2.07
CLN3-232ENST00000568443 SPDYE2Q495Y8 402 aa28■■■□□ 2.07
CLN3-232ENST00000568443 FZD1Q9UP38 647 aa28■■■□□ 2.07
CLN3-232ENST00000568443 BCAR3O75815 825 aa27.99■■■□□ 2.07
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CLN3-232ENST00000568443 SLC10A4Q96EP9 437 aa27.98■■■□□ 2.07
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CLN3-232ENST00000568443 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
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CLN3-232ENST00000568443 TCP10L2B9ZVM9 353 aa27.94■■■□□ 2.06
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CLN3-232ENST00000568443 SSC5DA1L4H1 1573 aa27.94■■■□□ 2.06
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CLN3-232ENST00000568443 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.93■■■□□ 2.06
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CLN3-232ENST00000568443 ZDHHC15Q96MV8 337 aa27.92■■■□□ 2.06
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CLN3-232ENST00000568443 GNAI2P04899 355 aa27.9■■■□□ 2.06
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CLN3-232ENST00000568443 GJA5P36382 358 aa27.79■■■□□ 2.04
CLN3-232ENST00000568443 MVPQ14764 893 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
CLN3-232ENST00000568443 OPTNQ96CV9 577 aa27.79■■■□□ 2.04
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CLN3-232ENST00000568443 RASGRF1Q13972 1273 aa27.78■■■□□ 2.04
CLN3-232ENST00000568443 GORABQ5T7V8 394 aa27.78■■■□□ 2.04
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