RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563854.1

NME3-205, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 5

Gene NME3, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-205ENST00000563854 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 ATP2B3Q16720 1220 aa22.02■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.02■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.02■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.02■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.01■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 CIAO1O76071 339 aa22.01■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 GNAI3P08754 354 aa22.01■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 TRIM27P14373 513 aa22.01■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 TNFAIP1Q13829 316 aa22.01■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.01■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 MYH13Q9UKX3 1938 aa22■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 DGKZQ13574 1117 aa22■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 TEKT1Q969V4 418 aa22■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.99■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.99■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.99■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 FBXO3Q9UK99 471 aa21.99■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.98■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 SRGAP3O43295 1099 aa21.98■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 CACNB3P54284 484 aa21.98■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.98■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 MAST3O60307 1309 aa21.98■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 TNNI2P48788 182 aa21.97■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 SREBF2Q12772 1141 aa21.97■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 SPRYD7Q5W111 196 aa21.97■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.97■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 TBC1D8O95759 1140 aa21.96■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.96■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.96■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 COPRSQ9NQ92 184 aa21.96■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.96■■□□□ 1.11
NME3-205ENST00000563854 ADORA1P30542 326 aa21.95■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 PHKA1P46020 1223 aa21.95■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 MAP3K11Q16584 847 aa21.95■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.95■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 GNAI2P04899 355 aa21.94■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.94■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 WNK4Q96J92 1243 aa21.94■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.94■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.94■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 TM4SF4P48230 202 aa21.93■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 OTOFQ9HC10 1997 aa21.92■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 PRDX5P30044 214 aa21.92■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 TFCP2Q12800 502 aa21.92■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.92■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 TEPSINQ96N21 525 aa21.92■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 ELP3Q9H9T3 547 aa21.92■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 TIMM10P62072 90 aa21.91■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 MTX1Q13505 466 aa21.91■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.91■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.91■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 CCDC102BQ68D86 513 aa21.9■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.9■■□□□ 1.1
NME3-205ENST00000563854 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.89■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 A0A1B0GUL7 405 aa21.89■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.89■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 MRIQ9BWK5 157 aa21.89■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.89■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.89■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 UNCXA6NJT0 531 aa21.88■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 SEMA3EO15041 775 aa21.88■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 GJA5P36382 358 aa21.88■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 OPTNQ96CV9 577 aa21.88■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.87■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 GPR25O00155 361 aa21.87■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 RASGRF1Q13972 1273 aa21.87■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 IFNL1Q8IU54 200 aa21.87■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.87■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 XAGE2Q96GT9 111 aa21.87■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.87■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 CSADQ9Y600 493 aa21.87■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.86■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 ALDH1A1P00352 501 aa21.86■■□□□ 1.09
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NME3-205ENST00000563854 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 VGLL4Q14135 290 aa21.86■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 GORABQ5T7V8 394 aa21.86■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 FAM83AQ86UY5 434 aa21.86■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.86■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.86■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 ABCF2Q9UG63 623 aa21.86■■□□□ 1.09
NME3-205ENST00000563854 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
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