RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.04■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NBPF3Q9H094 633 aa25.04■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.04■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBC1D10CQ8IV04 446 aa25.03■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NAPBQ9H115 298 aa25.03■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.03■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.03■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.03■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HS1BP3Q53T59 392 aa25.03■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.03■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.03■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RGS22Q8NE09 1264 aa25.03■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM87BQ96K49 555 aa25.03■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.03■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GNPATO15228 680 aa25.02■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCNQ4P56696 695 aa25.02■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.01■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ESPNB1AK53 854 aa25.01■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.01■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.01■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RNF214Q8ND24 703 aa25.01■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CNNM2Q9H8M5 875 aa25.01■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CPLX1O14810 134 aa25■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CERKQ8TCT0 537 aa25■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NLRP3Q96P20 1036 aa25■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARMT1Q9H993 441 aa25■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A0A1B0GUL6 1792 aa25■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTF1AQ7RTS3 328 aa25■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.99■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.99■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.99■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT23Q9C075 422 aa24.98■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.98■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.98■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GSG1L2A8MUP6 293 aa24.98■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SEMA3EO15041 775 aa24.98■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDKL5O76039 1030 aa24.98■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FDPSP14324 419 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.98■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.98■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.98■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 B4E1Z4 1266 aa24.97■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VPS37DQ86XT2 251 aa24.97■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FUCA2Q9BTY2 467 aa24.97■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RCOR1Q9UKL0 485 aa24.97■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CASZ1Q86V15 1759 aa24.97■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COL4A1P02462 1669 aa24.97■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC192P0DO97 292 aa24.96■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLCN1P35523 988 aa24.96■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TDO2P48775 406 aa24.96■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FOSBP53539 338 aa24.96■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAP3K11Q16584 847 aa24.96■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.96■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.96■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BICD2Q8TD16 824 aa24.96■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C8orf76Q96K31 380 aa24.96■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYH15Q9Y2K3 1946 aa24.96■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LIG1P18858 919 aa24.95■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYP7A1P22680 504 aa24.95■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GYG1P46976 350 aa24.95■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LCORLQ8N3X6 602 aa24.95■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LY75O60449 1722 aa24.95■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NEDD4P46934 1319 aa24.95■■□□□ 1.59
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.95■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTA3Q9BTC8 594 aa24.95■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RAI14Q9P0K7 980 aa24.95■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LIFRP42702 1097 aa24.94■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.94■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.94■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PGBD1Q96JS3 809 aa24.94■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.93■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.93■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TNMDQ9H2S6 317 aa24.93■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLSTN2Q9H4D0 955 aa24.93■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DACT1Q9NYF0 836 aa24.93■■□□□ 1.58
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C4AP0C0L4 1744 aa24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms