RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 C5P01031 1676 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 PXDNLA1KZ92 1463 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 TAF1LQ8IZX4 1826 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 A0A0G2JLW4 131 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 CLDN10P78369 228 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 PODNQ7Z5L7 613 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 PIK3C2GO75747 1445 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 ACEP12821 1306 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 KIF13BQ9NQT8 1826 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 EPHA4P54764 986 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 TBCELQ5QJ74 424 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 CCDC102BQ68D86 513 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 OGFOD1Q8N543 542 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 GLMNQ92990 594 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 ZIC5Q96T25 663 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 RNF181Q9P0P0 153 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 ABCC6O95255 1503 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 NOS2P35228 1153 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 TXLNAP40222 546 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 FOXK2Q01167 660 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 TEAD4Q15561 434 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 NLRP13Q86W25 1043 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa6.71□□□□□ -1.33
TMOD3-210ENST00000561408 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 TNP2Q05952 138 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 GGA1Q9UJY5 639 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 CNTNAP1P78357 1384 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 ROCK1Q13464 1354 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 CD33P20138 364 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 SERTM1A2A2V5 107 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 EML1O00423 815 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 FAM157BP0CG42 384 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 ARAFP10398 606 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 DPEP1P16444 411 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 AMPD1P23109 780 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 SIX5Q8N196 739 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 HCN2Q9UL51 889 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 TIAM2Q8IVF5 1701 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 SLIT3O75094 1523 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 A6NJR5 290 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 SFI1A8K8P3 1242 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 M0R2N6 131 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-210ENST00000561408 DLL1O00548 723 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms