RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.83■■□□□ 1.09
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARMC5Q96C12 935 aa21.83■■□□□ 1.09
USP3-AS1-210ENST00000561256 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.83■■□□□ 1.09
USP3-AS1-210ENST00000561256 TEPSINQ96N21 525 aa21.83■■□□□ 1.09
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.83■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 VPS37DQ86XT2 251 aa21.82■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.82■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.82■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.82■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 CSADQ9Y600 493 aa21.82■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.81■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 GTF2A2P52657 109 aa21.81■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 MAP3K9P80192 1104 aa21.81■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 VGLL4Q14135 290 aa21.81■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARHGEF6Q15052 776 aa21.81■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCL15Q16663 113 aa21.81■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.81■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.81■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 HTTP42858 3142 aa21.81■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.8■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 CAP1Q01518 475 aa21.8■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 OTUD5Q96G74 571 aa21.8■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 SUCLG2Q96I99 432 aa21.8■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.8■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 KAZALD1Q96I82 304 aa21.78■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.78■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 GRIK5Q16478 980 aa21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 NBPF11Q86T75 865 aa21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 TEKT1Q969V4 418 aa21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF333Q96JL9 665 aa21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.77■■□□□ 1.08
USP3-AS1-210ENST00000561256 CACNB3P54284 484 aa21.76■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 METTL24Q5JXM2 366 aa21.76■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.76■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 CENPFP49454 3210 aa21.75■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.75■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 CETPP11597 493 aa21.74■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.74■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 LRRC24Q50LG9 513 aa21.74■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 WRNIP1Q96S55 665 aa21.74■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 UTYO14607 1347 aa21.74■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 KIF22Q14807 665 aa21.73■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 ERO1BQ86YB8 467 aa21.73■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 HOOK2Q96ED9 719 aa21.73■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.73■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 PDE8BO95263 885 aa21.72■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.72■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 MAST3O60307 1309 aa21.72■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 BRCA2P51587 3418 aa21.71■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 TLR2O60603 784 aa21.71■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 BCAMP50895 628 aa21.71■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 SNAPC2Q13487 334 aa21.71■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM83AQ86UY5 434 aa21.71■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.71■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.71■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
USP3-AS1-210ENST00000561256 BTBD19C9JJ37 291 aa21.7■■□□□ 1.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 IRF6O14896 467 aa21.7■■□□□ 1.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 DCAF15Q66K64 600 aa21.7■■□□□ 1.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.7■■□□□ 1.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 MRIQ9BWK5 157 aa21.7■■□□□ 1.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.7■■□□□ 1.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.7■■□□□ 1.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 PPIL2Q13356 520 aa21.69■■□□□ 1.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.69■■□□□ 1.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.69■■□□□ 1.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.68■■□□□ 1.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.68■■□□□ 1.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 GNRH1P01148 92 aa21.67■■□□□ 1.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
USP3-AS1-210ENST00000561256 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms