RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 CYP4F22Q6NT55 531 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 TEKT1Q969V4 418 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 MRIQ9BWK5 157 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 DEFB129Q9H1M3 183 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 VEZTQ9HBM0 779 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 GPR108Q9NPR9 543 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZBTB22O15209 634 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 HMMRO75330 724 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 FKBP1BP68106 108 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 LDHBP07195 334 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 TNFAIP1Q13829 316 aa15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 RASGRF1Q13972 1273 aa15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 TNNI3KQ59H18 835 aa15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 ERC1Q8IUD2 1116 aa15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 SALL1Q9NSC2 1324 aa15.24■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa15.24■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.24■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 RGMBQ6NW40 437 aa15.24■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 HHIPL2Q6UWX4 724 aa15.24■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZDHHC15Q96MV8 337 aa15.24■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa15.24■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 AOX1Q06278 1338 aa15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRDX5P30044 214 aa15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 RASA3Q14644 834 aa15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC158Q5M9N0 1113 aa15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC102AQ96A19 550 aa15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMOD2Q9NZR1 351 aa15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 ABCF2Q9UG63 623 aa15.23■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 UBE2Q2LH0YL09 131 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAP2K2P36507 400 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 TNNI2P48788 182 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 TTC39AQ5SRH9 613 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 ARMC9Q7Z3E5 817 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 SPATA5Q8NB90 893 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 AIDAQ96BJ3 306 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 DBNDD2Q9BQY9 259 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 HMG20BQ9P0W2 317 aa15.22■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRPM7Q96QT4 1865 aa15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 TCP10L2B9ZVM9 353 aa15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 AOC2O75106 756 aa15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 RRP1P56182 461 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 NOGQ13253 232 aa15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRKG1Q13976 671 aa15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 DIXDC1Q155Q3 683 aa15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 MOB2Q70IA6 237 aa15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLF2Q8IX21 1173 aa15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 SIRT2Q8IXJ6 389 aa15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 ERICH6Q7L0X2 663 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 WBP1LQ9NX94 342 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa15.2■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 APBB1O00213 710 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 RAB11FIP3O75154 756 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 MCAMP43121 646 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 CACNB3P54284 484 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 PI16Q6UXB8 463 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 AACSQ86V21 672 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 RHPN1Q8TCX5 695 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 KIF1BPQ96EK5 621 aa15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 FKBP1CQ5VVH2 108 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM39BQ9GZU3 492 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 SNRKQ9NRH2 765 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 USP40Q9NVE5 1235 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 LRP2BPQ9P2M1 347 aa15.18■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC10A3P09131 477 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 GSTO1P78417 241 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 MECOMQ03112 1051 aa15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms