RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559898.5

HDDC3-205, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,024 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-205ENST00000559898 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-205ENST00000559898 ADORA1P30542 326 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-205ENST00000559898 NF2P35240 595 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-205ENST00000559898 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.15■■□□□ 1.14
HDDC3-205ENST00000559898 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 LPIN2Q92539 896 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 TEPSINQ96N21 525 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.14■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 MYO1BO43795 1136 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 SLC5A1P13866 664 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 ATP2B3Q16720 1220 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.13■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 CIAO1O76071 339 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 GJA5P36382 358 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 PHKA1P46020 1223 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 COPRSQ9NQ92 184 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.12■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 TBC1D8O95759 1140 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 MAP3K11Q16584 847 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.11■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 TIMM10P62072 90 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 DGKZQ13574 1117 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 SPRYD7Q5W111 196 aa22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 SRGAP3O43295 1099 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 LAMB1P07942 1786 aa22.09■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 GNAI3P08754 354 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 RLBP1P12271 317 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 PRDX5P30044 214 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 TM4SF4P48230 202 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 TFCP2Q12800 502 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 TEKT1Q969V4 418 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 WNK4Q96J92 1243 aa22.08■■□□□ 1.13
HDDC3-205ENST00000559898 MTX1Q13505 466 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 FBXO3Q9UK99 471 aa22.07■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.06■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.06■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.06■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.05■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 CCDC102BQ68D86 513 aa22.05■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 ELP3Q9H9T3 547 aa22.05■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.04■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.04■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.04■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 A0A1B0GUL7 405 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 GNAI2P04899 355 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 TNFAIP1Q13829 316 aa22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 NFIAQ12857 509 aa22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 RASGRF1Q13972 1273 aa22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 PI16Q6UXB8 463 aa22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 XAGE2Q96GT9 111 aa22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 MRIQ9BWK5 157 aa22.02■■□□□ 1.12
HDDC3-205ENST00000559898 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 PTPN18Q99952 460 aa22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.01■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 SREBF2Q12772 1141 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 VGLL4Q14135 290 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 IFNL1Q8IU54 200 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 OPTNQ96CV9 577 aa22■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 GPR25O00155 361 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 SLURP2P0DP57 97 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 TNNI2P48788 182 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 TCP10Q12799 353 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 ZNF384Q8TF68 577 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 AK9Q5TCS8 1911 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 MAST3O60307 1309 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.99■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 POLA2Q14181 598 aa21.98■■□□□ 1.11
HDDC3-205ENST00000559898 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.98■■□□□ 1.11
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