RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559642.1

BMP4-208, Transcript of bone morphogenetic protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene BMP4, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4-208ENST00000559642 SURF6O75683 361 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 RASGRF1Q13972 1273 aa15.94■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.94■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 WDR66Q8TBY9 1149 aa15.94■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 TEKT1Q969V4 418 aa15.94■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 NEUROD6Q96NK8 337 aa15.94■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 DEFB129Q9H1M3 183 aa15.94■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 PRDX5P30044 214 aa15.93■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 PRKG1Q13976 671 aa15.93■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 RGMBQ6NW40 437 aa15.93■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 DENND2AQ9ULE3 1009 aa15.93■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 DDX19BQ9UMR2 479 aa15.93■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 FZD1Q9UP38 647 aa15.93■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 MAST3O60307 1309 aa15.93■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 UBE2Q2LH0YL09 131 aa15.92■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 SEMA3EO15041 775 aa15.92■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 FOXN1O15353 648 aa15.92■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 NF2P35240 595 aa15.92■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 ZIC5Q96T25 663 aa15.92■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa15.92■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 OTOFQ9HC10 1997 aa15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 TCP10L2B9ZVM9 353 aa15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 CACNB3P54284 484 aa15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 FKBP1BP68106 108 aa15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 RASA3Q14644 834 aa15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 DIXDC1Q155Q3 683 aa15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 TNNI3KQ59H18 835 aa15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 GORABQ5T7V8 394 aa15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 PI16Q6UXB8 463 aa15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 AIDAQ96BJ3 306 aa15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 ZDHHC15Q96MV8 337 aa15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 WBP1LQ9NX94 342 aa15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 MYH2Q9UKX2 1941 aa15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 SALL1Q9NSC2 1324 aa15.91■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 LDHBP07195 334 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 SLC10A3P09131 477 aa15.9■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 RASAL3Q86YV0 1011 aa15.9■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa15.9■□□□□ 0.14
BMP4-208ENST00000559642 MAP2K2P36507 400 aa15.89■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 NOGQ13253 232 aa15.89■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 DBNDD2Q9BQY9 259 aa15.89■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 HMG20BQ9P0W2 317 aa15.89■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa15.89■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 MAST2Q6P0Q8 1798 aa15.89■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 AKAP11Q9UKA4 1901 aa15.88■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 ZBTB22O15209 634 aa15.88■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 TNFAIP1Q13829 316 aa15.88■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 PDE3AQ14432 1141 aa15.88■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 HHIPL2Q6UWX4 724 aa15.88■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 SIRT2Q8IXJ6 389 aa15.88■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 TMEM39BQ9GZU3 492 aa15.88■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 GPR108Q9NPR9 543 aa15.88■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 ABCF2Q9UG63 623 aa15.88■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 MCAMP43121 646 aa15.87■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 ARMC9Q7Z3E5 817 aa15.87■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 SPATA5Q8NB90 893 aa15.87■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 CCDC102AQ96A19 550 aa15.87■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 TEPSINQ96N21 525 aa15.87■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 MRIQ9BWK5 157 aa15.87■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 TMOD2Q9NZR1 351 aa15.87■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 TSKSQ9UJT2 592 aa15.87■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 APBB1O00213 710 aa15.86■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 TTC39AQ5SRH9 613 aa15.86■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa15.86■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa15.85■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 TNNI2P48788 182 aa15.85■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.85■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa15.85■□□□□ 0.13
BMP4-208ENST00000559642 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.1 ms