RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556687.5

RBM23-222, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 2

Gene RBM23, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-222	ENST00000556687	PRKG1	Q13976	671 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	PANK1	Q8TE04	598 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	VEZT	Q9HBM0	779 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	FZD1	Q9UP38	647 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	MYO1B	O43795	1136 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	NOG	Q13253	232 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	CCDC102A	Q96A19	550 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	SLC10A3	P09131	477 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	NF2	P35240	595 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	ATP8B2	P98198	1209 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	IFFO2	Q5TF58	517 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	TSKS	Q9UJT2	592 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687		A0A1B0GUL7	405 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	POLA2	Q14181	598 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	RASA3	Q14644	834 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	CCDC102B	Q68D86	513 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	XAGE2	Q96GT9	111 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	SSH3	Q8TE77	659 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	TEKT1	Q969V4	418 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	MRI	Q9BWK5	157 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	PRDX5	P30044	214 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	CACNB3	P54284	484 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	TNS4	Q8IZW8	715 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	CSRNP1	Q96S65	589 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-222	ENST00000556687	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	TEPSIN	Q96N21	525 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	SEMA3E	O15041	775 aa		15.13	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	RASGRF1	Q13972	1273 aa		15.13	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		15.13	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		15.13	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	MAST3	O60307	1309 aa		15.13	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		15.13	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		15.12	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	ZBTB22	O15209	634 aa		15.12	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	15.12	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	15.12	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	TNFAIP1	Q13829	316 aa		15.12	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	15.12	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	MAP3K11	Q16584	847 aa		15.12	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	CEP85	Q6P2H3	762 aa		15.12	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	COG6	Q9Y2V7	657 aa		15.12	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		15.12	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		15.12	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	CA12	O43570	354 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	MS4A1	P11836	297 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	TNNI2	P48788	182 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	15.11	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	GORAB	Q5T7V8	394 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	RNF186	Q9NXI6	227 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	ABCF2	Q9UG63	623 aa		15.11	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	15.11	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	TRPA1	O75762	1119 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	TNNI3K	Q59H18	835 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	PI16	Q6UXB8	463 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		15.1	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		15.09	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	SPRYD7	Q5W111	196 aa		15.09	■□□□□ 0.01
RBM23-222	ENST00000556687	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		15.09	■□□□□ 0.01

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