RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 CA12O43570 354 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 TNFAIP1Q13829 316 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 TEKT1Q969V4 418 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
NEDD1-208ENST00000555806 MAST3O60307 1309 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 ADORA1P30542 326 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 PHKA1P46020 1223 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 TFCP2Q12800 502 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 RASA3Q14644 834 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 FZD1Q9UP38 647 aa22.81■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 RLBP1P12271 317 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 A0A1B0GUL7 405 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 CAPN15O75808 1086 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 TNNI2P48788 182 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 TIMM10P62072 90 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.79■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 SEMA3EO15041 775 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC102BQ68D86 513 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 CSRNP1Q96S65 589 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 XAGE2Q96GT9 111 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 MRIQ9BWK5 157 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD1-208ENST00000555806 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 CACNB3P54284 484 aa22.76■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.76■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.76■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 TRPA1O75762 1119 aa22.75■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 PRDX5P30044 214 aa22.75■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 MAP3K11Q16584 847 aa22.75■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.75■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 PANK1Q8TE04 598 aa22.75■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.75■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 RNF186Q9NXI6 227 aa22.75■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.75■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 ATP8B2P98198 1209 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 POLA2Q14181 598 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 GORABQ5T7V8 394 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 RASGRF1Q13972 1273 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 MS4A1P11836 297 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 SPRYD7Q5W111 196 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 SSH3Q8TE77 659 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 TEPSINQ96N21 525 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.72■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 ABCF2Q9UG63 623 aa22.71■■□□□ 1.23
NEDD1-208ENST00000555806 ZBTB22O15209 634 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD1-208ENST00000555806 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
NEDD1-208ENST00000555806 SREBF2Q12772 1141 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD1-208ENST00000555806 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD1-208ENST00000555806 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
NEDD1-208ENST00000555806 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.7■■□□□ 1.22
NEDD1-208ENST00000555806 UNCXA6NJT0 531 aa22.69■■□□□ 1.22
NEDD1-208ENST00000555806 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.69■■□□□ 1.22
NEDD1-208ENST00000555806 FAM83AQ86UY5 434 aa22.69■■□□□ 1.22
NEDD1-208ENST00000555806 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
NEDD1-208ENST00000555806 WNK4Q96J92 1243 aa22.69■■□□□ 1.22
NEDD1-208ENST00000555806 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.69■■□□□ 1.22
NEDD1-208ENST00000555806 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NEDD1-208ENST00000555806 OTOFQ9HC10 1997 aa22.68■■□□□ 1.22
NEDD1-208ENST00000555806 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
NEDD1-208ENST00000555806 TM4SF4P48230 202 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD1-208ENST00000555806 TNNI3KQ59H18 835 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD1-208ENST00000555806 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD1-208ENST00000555806 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.67■■□□□ 1.22
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