RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555616.5

ACTN1-215, Transcript of actinin alpha 1, human

TSL 3

Gene ACTN1, Length 919 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACTN1-215	ENST00000555616	GRM1	Q13255	1194 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ACTN1-215	ENST00000555616	GRIK5	Q16478	980 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ACTN1-215	ENST00000555616	RGMB	Q6NW40	437 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ACTN1-215	ENST00000555616	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ACTN1-215	ENST00000555616	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ACTN1-215	ENST00000555616	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ACTN1-215	ENST00000555616	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ACTN1-215	ENST00000555616	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	SEMA3E	O15041	775 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	CRK	P46108	304 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	POLA2	Q14181	598 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	MAST3	O60307	1309 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	SLC10A3	P09131	477 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	ADORA1	P30542	326 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	NF2	P35240	595 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	11.88	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	TFCP2	Q12800	502 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	SSH3	Q8TE77	659 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	CCDC102A	Q96A19	550 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616		A0A1B0GUL7	405 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	PHKA1	P46020	1223 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	TNFAIP1	Q13829	316 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	TEKT1	Q969V4	418 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	MRI	Q9BWK5	157 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	CA12	O43570	354 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	RASGRF1	Q13972	1273 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	CCDC102B	Q68D86	513 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	MOB2	Q70IA6	237 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	ZIC5	Q96T25	663 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	PRDX5	P30044	214 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	ATP8B2	P98198	1209 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	RASA3	Q14644	834 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	MAP3K11	Q16584	847 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	XAGE2	Q96GT9	111 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	HMMR	O75330	724 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	TIMM10	P62072	90 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.84	□□□□□ -0.51	2e-8	■■□□□ 12
ACTN1-215	ENST00000555616	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	CEP85	Q6P2H3	762 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	GPR108	Q9NPR9	543 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ACTN1-215	ENST00000555616	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	LBX1	P52954	281 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	TEPSIN	Q96N21	525 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	UNCX	A6NJT0	531 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	TNNI2	P48788	182 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	FAM83A	Q86UY5	434 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
ACTN1-215	ENST00000555616	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		11.82	□□□□□ -0.52

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