RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554018.1

TRAPPC6B-204, Transcript of trafficking protein particle complex 6B, humanhuman

TSL 4

Gene TRAPPC6B, Length 541 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6B-204ENST00000554018 OTOFQ9HC10 1997 aa14.84□□□□□ -0.03
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TRAPPC6B-204ENST00000554018 SLC5A1P13866 664 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6B-204ENST00000554018 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6B-204ENST00000554018 LPIN2Q92539 896 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6B-204ENST00000554018 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC6B-204ENST00000554018 AK9Q5TCS8 1911 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC6B-204ENST00000554018 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
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TRAPPC6B-204ENST00000554018 HTTP42858 3142 aa14.76□□□□□ -0.05
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TRAPPC6B-204ENST00000554018 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.75□□□□□ -0.05
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TRAPPC6B-204ENST00000554018 ELP3Q9H9T3 547 aa14.75□□□□□ -0.05
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TRAPPC6B-204ENST00000554018 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
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TRAPPC6B-204ENST00000554018 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6B-204ENST00000554018 FAM83AQ86UY5 434 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6B-204ENST00000554018 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6B-204ENST00000554018 OPTNQ96CV9 577 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6B-204ENST00000554018 XAGE2Q96GT9 111 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6B-204ENST00000554018 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6B-204ENST00000554018 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC6B-204ENST00000554018 ALDH1A1P00352 501 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC6B-204ENST00000554018 RASGRF1Q13972 1273 aa14.72□□□□□ -0.05
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