RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 RAB34Q9BZG1 259 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRB-210ENST00000551525 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.14□□□□□ -1.27
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PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB22O15209 634 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 PSEN1P49768 467 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 USP48Q86UV5 1035 aa7.14□□□□□ -1.27
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PTPRB-210ENST00000551525 GJA8P48165 433 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 ODF2Q5BJF6 829 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 BRINP3Q76B58 766 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-210ENST00000551525 C2CD5Q86YS7 1000 aa7.14□□□□□ -1.27
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