RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548092.5

TRAFD1-204, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAFD1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-204ENST00000548092 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 FAM135AQ9P2D6 1515 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM94Q12767 1356 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 SAMD9Q5K651 1589 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 UGGT1Q9NYU2 1555 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 NOS3P29474 1203 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 MTMR3Q13615 1198 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 SETDB1Q15047 1291 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 ABTB2Q8N961 1025 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 CNTN3Q9P232 1028 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 NLRP1Q9C000 1473 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 ARHGAP5Q13017 1502 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 A6NHS1 94 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 ALX3O95076 343 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 C1QTNF8P60827 252 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 HELQQ8TDG4 1101 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 EDEM1Q92611 657 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 TP53INP1Q96A56 240 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 ELP3Q9H9T3 547 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 TIAM1Q13009 1591 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 DIP2AQ14689 1571 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 KIF4AO95239 1232 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 HYAL2Q12891 473 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 CEP120Q8N960 986 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 PZPP20742 1482 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 LINC01387J3KSC0 135 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 TM4SF5O14894 197 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 MPSTP25325 297 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 CEP135Q66GS9 1140 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 RBSNQ9H1K0 784 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 PDGFAP04085 211 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 ACPPP15309 386 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.65□□□□□ -1.34
TRAFD1-204ENST00000548092 TRPA1O75762 1119 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 CDC25BP30305 580 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 XKR5Q6UX68 686 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 C14orf37Q86TY3 774 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.64□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 SPACA7Q96KW9 195 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 PBX4Q9BYU1 374 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 PPME1Q9Y570 386 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 ABCC3O15438 1527 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 F8W735 103 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 NFKBIEO00221 500 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 C8orf34Q49A92 452 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 DEFB132Q7Z7B7 95 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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TRAFD1-204ENST00000548092 CHRDQ9H2X0 955 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 POLIQ9UNA4 740 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 A2MP01023 1474 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 NPR3P17342 541 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 EPHA1P21709 976 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 CDC27P30260 824 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 GGT6Q6P531 493 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 MSH6P52701 1360 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 WISP1O95388 367 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAFD1-204ENST00000548092 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.61□□□□□ -1.35
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