RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545097.1

CCR3-208, Transcript of C-C motif chemokine receptor 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR3, Length 1,786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCR3-208	ENST00000545097	GRM1	Q13255	1194 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	FBXO3	Q9UK99	471 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	SIPA1L1	O43166	1804 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	AK9	Q5TCS8	1911 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	CRK	P46108	304 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	VPS37D	Q86XT2	251 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	SLURP2	P0DP57	97 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	PRKG1	Q13976	671 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	DLGAP5	Q15398	846 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	SULF1	Q8IWU6	871 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	OGFOD1	Q8N543	542 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	CAPNS2	Q96L46	248 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	MCAM	P43121	646 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	TNNI3K	Q59H18	835 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	SNRK	Q9NRH2	765 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	FOXN1	O15353	648 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	10.05	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	HUNK	P57058	714 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	TEPSIN	Q96N21	525 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	VEZT	Q9HBM0	779 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	MYH7	P12883	1935 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	APBB1	O00213	710 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	10.04	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	TSKS	Q9UJT2	592 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	HTT	P42858	3142 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	NFIA	Q12857	509 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	PDE3A	Q14432	1141 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	RASA3	Q14644	834 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	CRBN	Q96SW2	442 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CCR3-208	ENST00000545097	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	BCL11A	Q9H165	835 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	WBP1L	Q9NX94	342 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	CHGB	P05060	677 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	SLC10A3	P09131	477 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	GJA5	P36382	358 aa		10.01	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
CCR3-208	ENST00000545097	RGMB	Q6NW40	437 aa		10.01	□□□□□ -0.81

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