RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534967.1

GOLGA3-204, Transcript of golgin A3, human

TSL 3

Gene GOLGA3, Length 484 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GOLGA3-204	ENST00000534967	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GOLGA3-204	ENST00000534967	MRS2	Q9HD23	443 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GOLGA3-204	ENST00000534967	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
GOLGA3-204	ENST00000534967	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
GOLGA3-204	ENST00000534967	ARMC5	Q96C12	935 aa		33.36	■■■□□ 2.93
GOLGA3-204	ENST00000534967	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		33.36	■■■□□ 2.93
GOLGA3-204	ENST00000534967	CRK	P46108	304 aa		33.35	■■■□□ 2.93
GOLGA3-204	ENST00000534967	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		33.35	■■■□□ 2.93
GOLGA3-204	ENST00000534967	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		33.35	■■■□□ 2.93
GOLGA3-204	ENST00000534967	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
GOLGA3-204	ENST00000534967	ALDH1L1	O75891	902 aa		33.34	■■■□□ 2.93
GOLGA3-204	ENST00000534967	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		33.34	■■■□□ 2.93
GOLGA3-204	ENST00000534967	SUCLG2	Q96I99	432 aa		33.34	■■■□□ 2.93
GOLGA3-204	ENST00000534967	VGLL4	Q14135	290 aa		33.33	■■■□□ 2.93
GOLGA3-204	ENST00000534967	GRIK5	Q16478	980 aa		33.33	■■■□□ 2.93
GOLGA3-204	ENST00000534967	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
GOLGA3-204	ENST00000534967	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	KAZALD1	Q96I82	304 aa		33.32	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		33.32	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		33.31	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	TNNI2	P48788	182 aa		33.31	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	MAP3K9	P80192	1104 aa		33.31	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	CCL15	Q16663	113 aa		33.31	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	33.3	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		33.3	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	BRCA2	P51587	3418 aa		33.3	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	GTF2A2	P52657	109 aa		33.29	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	OTUD5	Q96G74	571 aa		33.29	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		33.29	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	CSAD	Q9Y600	493 aa		33.29	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		33.28	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	VPS37D	Q86XT2	251 aa		33.28	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		33.28	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	CACNB3	P54284	484 aa		33.27	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		33.27	■■■□□ 2.92
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZNF333	Q96JL9	665 aa		33.26	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		33.26	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		33.25	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	ARHGEF6	Q15052	776 aa		33.24	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	LRRC24	Q50LG9	513 aa		33.24	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		33.23	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	METTL24	Q5JXM2	366 aa		33.23	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		33.23	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	TEKT1	Q969V4	418 aa		33.23	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		33.22	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		33.22	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		33.22	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	UTY	O14607	1347 aa		33.22	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	NBPF11	Q86T75	865 aa		33.2	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	WRNIP1	Q96S55	665 aa		33.2	■■■□□ 2.91
GOLGA3-204	ENST00000534967	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		33.19	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		33.19	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	PDE8B	O95263	885 aa		33.18	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	CETP	P11597	493 aa		33.18	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	BCAM	P50895	628 aa		33.18	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	ERO1B	Q86YB8	467 aa		33.18	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		33.18	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		33.18	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		33.18	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		33.17	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		33.17	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	BTBD19	C9JJ37	291 aa		33.16	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	IRF6	O14896	467 aa		33.16	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	TLR2	O60603	784 aa		33.16	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	FAM83A	Q86UY5	434 aa		33.16	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		33.16	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	ANP32C	O43423	234 aa		33.14	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	SNAPC2	Q13487	334 aa		33.14	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		33.14	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	MRI	Q9BWK5	157 aa		33.14	■■■□□ 2.9
GOLGA3-204	ENST00000534967	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
GOLGA3-204	ENST00000534967	PPIL2	Q13356	520 aa		33.13	■■■□□ 2.89
GOLGA3-204	ENST00000534967	KIF22	Q14807	665 aa		33.13	■■■□□ 2.89
GOLGA3-204	ENST00000534967	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		33.13	■■■□□ 2.89
GOLGA3-204	ENST00000534967	HOOK2	Q96ED9	719 aa		33.13	■■■□□ 2.89
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
GOLGA3-204	ENST00000534967	MAST3	O60307	1309 aa		33.12	■■■□□ 2.89
GOLGA3-204	ENST00000534967	DCAF15	Q66K64	600 aa		33.11	■■■□□ 2.89
GOLGA3-204	ENST00000534967	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		33.11	■■■□□ 2.89
GOLGA3-204	ENST00000534967	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
GOLGA3-204	ENST00000534967	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		33.1	■■■□□ 2.89
GOLGA3-204	ENST00000534967	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		33.1	■■■□□ 2.89
GOLGA3-204	ENST00000534967	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
GOLGA3-204	ENST00000534967	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
GOLGA3-204	ENST00000534967	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
GOLGA3-204	ENST00000534967	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
GOLGA3-204	ENST00000534967	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		33.09	■■■□□ 2.89

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