RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
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PKP3-209ENST00000533069 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.6■□□□□ 0.89
PKP3-209ENST00000533069 CA12O43570 354 aa20.59■□□□□ 0.89
PKP3-209ENST00000533069 SLC10A3P09131 477 aa20.59■□□□□ 0.89
PKP3-209ENST00000533069 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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PKP3-209ENST00000533069 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PKP3-209ENST00000533069 SSH3Q8TE77 659 aa20.59■□□□□ 0.89
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PKP3-209ENST00000533069 PHKA1P46020 1223 aa20.58■□□□□ 0.89
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PKP3-209ENST00000533069 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
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PKP3-209ENST00000533069 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PKP3-209ENST00000533069 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.57■□□□□ 0.88
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PKP3-209ENST00000533069 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.55■□□□□ 0.88
PKP3-209ENST00000533069 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PKP3-209ENST00000533069 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PKP3-209ENST00000533069 TNNI2P48788 182 aa20.55■□□□□ 0.88
PKP3-209ENST00000533069 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PKP3-209ENST00000533069 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
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PKP3-209ENST00000533069 RASGRF1Q13972 1273 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-209ENST00000533069 MAP3K11Q16584 847 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-209ENST00000533069 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-209ENST00000533069 ZIC5Q96T25 663 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-209ENST00000533069 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-209ENST00000533069 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.54■□□□□ 0.88
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PKP3-209ENST00000533069 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
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PKP3-209ENST00000533069 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
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PKP3-209ENST00000533069 PRDX5P30044 214 aa20.52■□□□□ 0.88
PKP3-209ENST00000533069 PRKG1Q13976 671 aa20.52■□□□□ 0.88
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PKP3-209ENST00000533069 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PKP3-209ENST00000533069 CEP85Q6P2H3 762 aa20.52■□□□□ 0.88
PKP3-209ENST00000533069 TNS4Q8IZW8 715 aa20.52■□□□□ 0.88
PKP3-209ENST00000533069 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PKP3-209ENST00000533069 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.51■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.51■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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PKP3-209ENST00000533069 FAM83AQ86UY5 434 aa20.5■□□□□ 0.87
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PKP3-209ENST00000533069 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.5■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.49■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.49■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 SLF2Q8IX21 1173 aa20.49■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 TEPSINQ96N21 525 aa20.49■□□□□ 0.87
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PKP3-209ENST00000533069 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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PKP3-209ENST00000533069 CSRNP1Q96S65 589 aa20.48■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.48■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 COG6Q9Y2V7 657 aa20.48■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.47■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 SPATA5Q8NB90 893 aa20.47■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.47■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.47■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 ABCF2Q9UG63 623 aa20.47■□□□□ 0.87
PKP3-209ENST00000533069 FZD1Q9UP38 647 aa20.47■□□□□ 0.87
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