RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531500.5

RBM25-209, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 3

Gene RBM25, Length 1,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-209	ENST00000531500	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RBM25-209	ENST00000531500	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM25-209	ENST00000531500	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM25-209	ENST00000531500	TRAF5	O00463	557 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM25-209	ENST00000531500	PRDX5	P30044	214 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM25-209	ENST00000531500	MCAM	P43121	646 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM25-209	ENST00000531500	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM25-209	ENST00000531500	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM25-209	ENST00000531500	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM25-209	ENST00000531500	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM25-209	ENST00000531500	PASK	Q96RG2	1323 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM25-209	ENST00000531500	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	SPDYE6	P0CI01	402 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	ADM5	C9JUS6	153 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	SLF2	Q8IX21	1173 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	GCC1	Q96CN9	775 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	ZAP70	P43403	619 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	CREBZF	Q9NS37	354 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	GSTO1	P78417	241 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	HTRA3	P83110	453 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	DLK2	Q6UY11	383 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	LDHC	P07864	332 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	NF2	P35240	595 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	TNNI2	P48788	182 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	MECOM	Q03112	1051 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	TNFAIP1	Q13829	316 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	CST9	Q5W186	159 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	CDCA5	Q96FF9	252 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM25-209	ENST00000531500	IGSF3	O75054	1194 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	IGHD	P01880	384 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	ATP5J	P18859	108 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	RASA3	Q14644	834 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	AOX1	Q06278	1338 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	BTD	P43251	543 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	CACNB3	P54284	484 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	MAP3K12	Q12852	859 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBM25-209	ENST00000531500	GAK	O14976	1311 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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