RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 RASGRF1Q13972 1273 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRU-211ENST00000531385 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRU-211ENST00000531385 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRU-211ENST00000531385 MYO1BO43795 1136 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRU-211ENST00000531385 ECE1P42892 770 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRU-211ENST00000531385 PRKG1Q13976 671 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRU-211ENST00000531385 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRU-211ENST00000531385 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRU-211ENST00000531385 FZD1Q9UP38 647 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRU-211ENST00000531385 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 PI16Q6UXB8 463 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 TEKT1Q969V4 418 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 CACNB3P54284 484 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 TNNI3KQ59H18 835 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 ZIC5Q96T25 663 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 SEMA3EO15041 775 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 GORABQ5T7V8 394 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 RGMBQ6NW40 437 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 PDE3AQ14432 1141 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 RASA3Q14644 834 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 MAST3O60307 1309 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 FOXN1O15353 648 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 NF2P35240 595 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 WBP1LQ9NX94 342 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 ABCF2Q9UG63 623 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 APBB1O00213 710 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 GPR108Q9NPR9 543 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRU-211ENST00000531385 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 MCAMP43121 646 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 FKBP1BP68106 108 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 SLC10A3P09131 477 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 SPATA5Q8NB90 893 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 AIDAQ96BJ3 306 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 BCL11AQ9H165 835 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 SNRKQ9NRH2 765 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 ZBTB22O15209 634 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 TNFAIP1Q13829 316 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 TEPSINQ96N21 525 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 MRIQ9BWK5 157 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 TSKSQ9UJT2 592 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 MAP2K2P36507 400 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 NOGQ13253 232 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 OTOFQ9HC10 1997 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 AACSQ86V21 672 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF384Q8TF68 577 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 HMMRO75330 724 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRU-211ENST00000531385 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms