RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 GATAD2BQ8WXI9 593 aa11.44□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 TNFRSF25Q93038 417 aa11.44□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 SHDQ96IW2 340 aa11.44□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM55Q9BYV6 548 aa11.44□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 PRKAG3Q9UGI9 489 aa11.44□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM221AA4D161 298 aa11.43□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD62A6NC57 917 aa11.43□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 SEPT6Q14141 434 aa11.43□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 PERM1Q5SV97 790 aa11.43□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF662Q6ZS27 426 aa11.43□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 SULF2Q8IWU5 870 aa11.43□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 STK35Q8TDR2 534 aa11.43□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 MKL1Q969V6 931 aa11.43□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 SIRPGQ9P1W8 387 aa11.43□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB33AQ14088 237 aa11.42□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 MPP2Q14168 576 aa11.42□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 ADAM19Q9H013 955 aa11.42□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 CYP8B1Q9UNU6 501 aa11.42□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM33Q9UPN9 1127 aa11.42□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 NCLP19338 710 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa11.41□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 SV2AQ7L0J3 742 aa11.41□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.41□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 CILPO75339 1184 aa11.4□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 MCM4P33991 863 aa11.4□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 ADH7P40394 386 aa11.4□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC14Q15048 493 aa11.4□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 LLGL2Q6P1M3 1020 aa11.4□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa11.4□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 LPIN3Q9BQK8 851 aa11.4□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 KLF15Q9UIH9 416 aa11.4□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 ARNTP27540 789 aa11.39□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa11.39□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 GAL3ST3Q96A11 431 aa11.39□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 CBX8Q9HC52 389 aa11.39□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa11.38□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 EIF6P56537 245 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 REC114Q7Z4M0 266 aa11.38□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM169BQ8N8A8 192 aa11.38□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 FERD3LQ96RJ6 166 aa11.38□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 ADH6P28332 368 aa11.37□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF165P49910 485 aa11.37□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 TNNI3KQ59H18 835 aa11.37□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 MDFIQ99750 246 aa11.37□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa11.37□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 BRMS1Q9HCU9 246 aa11.37□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 SNTG2Q9NY99 539 aa11.37□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 FRRS1LQ9P0K9 344 aa11.37□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 BPNT1O95861 308 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 ARAFP10398 606 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 MX2P20592 715 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 GIPRP48546 466 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 IKBKEQ14164 716 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 TCEAL1Q15170 157 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 FBXW10Q5XX13 1052 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 KANK3Q6NY19 840 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM177BA6PVY3 158 aa11.35□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 EPHA1P21709 976 aa11.35□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 CDC27P30260 824 aa11.35□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 RASA3Q14644 834 aa11.35□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 DEPDC7Q96QD5 511 aa11.35□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 CRBNQ96SW2 442 aa11.35□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNRF3Q9ULT6 936 aa11.35□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa11.35□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 CLCQ05315 142 aa11.34□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 GAS6Q14393 721 aa11.34□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa11.34□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 GK5Q6ZS86 529 aa11.34□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 PDZD3Q86UT5 571 aa11.34□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 FCHSD1Q86WN1 690 aa11.34□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM221BA6H8Z2 402 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-205ENST00000514178 CABP4P57796 275 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-205ENST00000514178 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-205ENST00000514178 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-205ENST00000514178 TTC9Q92623 222 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-205ENST00000514178 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-205ENST00000514178 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms