RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 RUBCNLQ9H714 662 aa9.88□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 GPAMQ9HCL2 828 aa9.88□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 DACH1Q9UI36 760 aa9.88□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 DLC1Q96QB1 1528 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 KIF1AQ12756 1690 aa9.87□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 SLC35F4A4IF30 521 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 E9PSI1 815 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 TECPR2O15040 1411 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 EPB42P16452 691 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 FGD1P98174 961 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 PTSQ03393 145 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 UNC5CLQ8IV45 518 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 GIPC2Q8TF65 315 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 RREB1Q92766 1687 aa9.86□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 NUP188Q5SRE5 1749 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 H7C1W4 665 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 GPR182O15218 404 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 ANP32CO43423 234 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 NEFLP07196 543 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 TYRO3Q06418 890 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 FIGNL1Q6PIW4 674 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 WAPLQ7Z5K2 1190 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 TRIM47Q96LD4 638 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 CEP63Q96MT8 703 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa9.85□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 NPHP3Q7Z494 1330 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 XKR5Q6UX68 686 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.84□□□□□ -0.83
HERC3-210ENST00000512194 SOBPA7XYQ1 873 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 C8orf34Q49A92 452 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 GMCL1Q96IK5 515 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 CDK19Q9BWU1 502 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 BCL11AQ9H165 835 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.83□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 KCNQ4P56696 695 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.82□□□□□ -0.84
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HERC3-210ENST00000512194 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 BRD7Q9NPI1 651 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 KCNMB2Q9Y691 235 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa9.82□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 UNCXA6NJT0 531 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 FAM157BP0CG42 384 aa9.81□□□□□ -0.84
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HERC3-210ENST00000512194 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 KNSTRNQ9Y448 316 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.81□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 ALS2Q96Q42 1657 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 EGFRP00533 1210 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 MAPK8P45983 427 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 FAM182BQ5T319 152 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 PANK3Q9H999 370 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 DISP2A7MBM2 1401 aa9.8□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
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HERC3-210ENST00000512194 LAMC2Q13753 1193 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 DNAJC25Q9H1X3 360 aa9.79□□□□□ -0.84
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HERC3-210ENST00000512194 TNS3Q68CZ2 1445 aa9.79□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 EFSO43281 561 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 THBS1P07996 1170 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 YY1P25490 414 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 BAG6P46379 1132 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 ZNF438Q7Z4V0 828 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 KCNH4Q9UQ05 1017 aa9.78□□□□□ -0.84
HERC3-210ENST00000512194 A6NHS1 94 aa9.77□□□□□ -0.85
HERC3-210ENST00000512194 XYLBO75191 536 aa9.77□□□□□ -0.85
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