RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 VGLL4Q14135 290 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 WWC1Q8IX03 1113 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 OTUD5Q96G74 571 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 CCDC27Q2M243 656 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 TEPSINQ96N21 525 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 CETPP11597 493 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 CRKP46108 304 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 GYG1P46976 350 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 UBE4AQ14139 1066 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 VPS37DQ86XT2 251 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 F6X3S4 739 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 H0YGN5 161 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 TLR2O60603 784 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 BEND3Q5T5X7 828 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 IL16Q14005 1332 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 GNRH1P01148 92 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 DPF3Q92784 378 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-215ENST00000510074 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 GRM8O00222 908 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 VAMP4O75379 141 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 PRMT2P55345 433 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 SNAPC2Q13487 334 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 ERO1BQ86YB8 467 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 HOOK2Q96ED9 719 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 BRCA2P51587 3418 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 BTBD19C9JJ37 291 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 TEKT1Q969V4 418 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 WRNIP1Q96S55 665 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 LAMB1P07942 1786 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 IRF6O14896 467 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 HOXD10P28358 340 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 CACNB3P54284 484 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 DCAF15Q66K64 600 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 PPIL2Q13356 520 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 RAET1EQ8TD07 263 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-215ENST00000510074 PSMC4P43686 418 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 GRIK5Q16478 980 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM83AQ86UY5 434 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 MRIQ9BWK5 157 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 CPA4Q9UI42 421 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 CEP290O15078 2479 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 ALDH1L1O75891 902 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 PPATQ06203 517 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 MTFR1Q15390 333 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 C17orf99Q6UX52 265 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 MIGA2Q7L4E1 593 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 SRRDQ9UH36 339 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 METTL24Q5JXM2 366 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 FKBP1CQ5VVH2 108 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 WDR63Q8IWG1 891 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 TRIM47Q96LD4 638 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF341Q9BYN7 854 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 OTOFQ9HC10 1997 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 PDHXO00330 501 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 GRK4P32298 578 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 HTATIP2Q9BUP3 242 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 MAST3O60307 1309 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-215ENST00000510074 CCDC184Q52MB2 194 aa19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms