RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507771.5

ITGA3-210, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 399 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-210ENST00000507771 SCNN1DP51172 638 aa13.5□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 PI4K2BQ8TCG2 481 aa13.5□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 TEKT1Q969V4 418 aa13.5□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 GMLQ99445 158 aa13.5□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 SERPINA10Q9UK55 444 aa13.5□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa13.5□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa13.49□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 MYO1BO43795 1136 aa13.49□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 PRDX5P30044 214 aa13.49□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 EPHX2P34913 555 aa13.49□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 DLGAP5Q15398 846 aa13.49□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa13.49□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 CNTROBQ8N137 903 aa13.49□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 MRIQ9BWK5 157 aa13.49□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 RRAGCQ9HB90 399 aa13.49□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 MYOZ2Q9NPC6 264 aa13.49□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 WDR90Q96KV7 1748 aa13.48□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 PDE4AP27815 886 aa13.48□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 EPS15P42566 896 aa13.48□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 EVI5LQ96CN4 794 aa13.48□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa13.48□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 CRKP46108 304 aa13.47□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 RGS3P49796 1198 aa13.47□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 MECOMQ03112 1051 aa13.47□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa13.47□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 CFAP100Q494V2 611 aa13.47□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 HHIPL2Q6UWX4 724 aa13.47□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 FSD1Q9BTV5 496 aa13.47□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 ANTXR1Q9H6X2 564 aa13.47□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 SCN4AP35499 1836 aa13.47□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 AKAP11Q9UKA4 1901 aa13.47□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 BAG3O95817 575 aa13.46□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa13.46□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 TICAM2Q86XR7 235 aa13.46□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 CERS3Q8IU89 383 aa13.46□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 MAGEB6Q8N7X4 407 aa13.46□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 KBTBD3Q8NAB2 608 aa13.46□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 MTMR14Q8NCE2 650 aa13.46□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 RILPL2Q969X0 211 aa13.46□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 TMOD2Q9NZR1 351 aa13.46□□□□□ -0.25
ITGA3-210ENST00000507771 CYP7A1P22680 504 aa13.45□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 GRIK5Q16478 980 aa13.45□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 TTC22Q5TAA0 569 aa13.45□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 SAMD7Q7Z3H4 446 aa13.45□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 ZDHHC15Q96MV8 337 aa13.45□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 NMRK2Q9NPI5 230 aa13.45□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 CLEC11AQ9Y240 323 aa13.45□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa13.44□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 SPDYE2BA6NHP3 402 aa13.44□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 HIP1O00291 1037 aa13.44□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 SPDYE6P0CI01 402 aa13.44□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 DIXDC1Q155Q3 683 aa13.44□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 MAST2Q6P0Q8 1798 aa13.43□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 SHTN1A0MZ66 631 aa13.43□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 POTECB2RU33 542 aa13.43□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 PDE6AP16499 860 aa13.43□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 PLCG2P16885 1265 aa13.43□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 UBE3CQ15386 1083 aa13.43□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 TRPM4Q8TD43 1214 aa13.43□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa13.43□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 GAKO14976 1311 aa13.42□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF532Q9HCE3 1301 aa13.42□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 WNT10BO00744 389 aa13.42□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 ADD2P35612 726 aa13.42□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 BTDP43251 543 aa13.42□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 TNNI2P48788 182 aa13.42□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 TNFAIP1Q13829 316 aa13.42□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 LDHDQ86WU2 507 aa13.42□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 RFX7Q2KHR2 1363 aa13.42□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa13.41□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa13.41□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 NBPF9Q3BBW0 867 aa13.41□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 BMP2KLQ5H9B9 411 aa13.41□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 AIDAQ96BJ3 306 aa13.41□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 VEZTQ9HBM0 779 aa13.41□□□□□ -0.26
ITGA3-210ENST00000507771 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms