RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PGGT1B-204ENST00000503638 HMG20BQ9P0W2 317 aa16.34■□□□□ 0.21
PGGT1B-204ENST00000503638 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PGGT1B-204ENST00000503638 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.34■□□□□ 0.21
PGGT1B-204ENST00000503638 PASKQ96RG2 1323 aa16.34■□□□□ 0.21
PGGT1B-204ENST00000503638 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PGGT1B-204ENST00000503638 FOXN1O15353 648 aa16.33■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 LDHBP07195 334 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
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PGGT1B-204ENST00000503638 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 ECHDC1Q9NTX5 307 aa16.33■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 LRP2BPQ9P2M1 347 aa16.33■□□□□ 0.2
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PGGT1B-204ENST00000503638 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.32■□□□□ 0.2
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PGGT1B-204ENST00000503638 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 RAI14Q9P0K7 980 aa16.32■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa16.32■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 PSME4Q14997 1843 aa16.31■□□□□ 0.2
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PGGT1B-204ENST00000503638 ZAP70P43403 619 aa16.31■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa16.31■□□□□ 0.2
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PGGT1B-204ENST00000503638 MYOZ2Q9NPC6 264 aa16.31■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 CNTNAP1P78357 1384 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
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PGGT1B-204ENST00000503638 ERC2O15083 957 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 PRDX5P30044 214 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 VEGFBP49765 207 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 DLGAP5Q15398 846 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 ERICH6Q7L0X2 663 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
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PGGT1B-204ENST00000503638 GMLQ99445 158 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 PPP4R2Q9NY27 417 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 IDH1O75874 414 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
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PGGT1B-204ENST00000503638 GRIK5Q16478 980 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 ERICH6BQ5W0A0 696 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 TRPM4Q8TD43 1214 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 TEKT1Q969V4 418 aa16.29■□□□□ 0.2
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PGGT1B-204ENST00000503638 SALL1Q9NSC2 1324 aa16.28■□□□□ 0.2
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PGGT1B-204ENST00000503638 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 CFAP100Q494V2 611 aa16.28■□□□□ 0.2
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PGGT1B-204ENST00000503638 TTC41PQ6P2S7 1318 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 MYO1BO43795 1136 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 EGFRP00533 1210 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 CRKP46108 304 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 DIXDC1Q155Q3 683 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 PAG1Q9NWQ8 432 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-204ENST00000503638 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM88BA6NKF7 163 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 SPDYE6P0CI01 402 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 MMP14P50281 582 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 GSTO1P78417 241 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 MAP3K12Q12852 859 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 SLF2Q8IX21 1173 aa16.26■□□□□ 0.19
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PGGT1B-204ENST00000503638 HAUS7Q99871 368 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 ANTXR1Q9H6X2 564 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 SERPINA10Q9UK55 444 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 MECOMQ03112 1051 aa16.25■□□□□ 0.19
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PGGT1B-204ENST00000503638 CNTROBQ8N137 903 aa16.25■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16.25■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 WBP1LQ9NX94 342 aa16.25■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 GGA3Q9NZ52 723 aa16.25■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 CLRN2A0PK11 232 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 PDE1AP54750 535 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 NBPF9Q3BBW0 867 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP16.24■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 VEZTQ9HBM0 779 aa16.24■□□□□ 0.19
PGGT1B-204ENST00000503638 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa16.24■□□□□ 0.19
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