RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-202ENST00000498438 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.79■■□□□ 1.24
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HOXD11-202ENST00000498438 SLC10A3P09131 477 aa22.78■■□□□ 1.24
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HOXD11-202ENST00000498438 POLA2Q14181 598 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXD11-202ENST00000498438 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.78■■□□□ 1.24
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HOXD11-202ENST00000498438 ATP8B2P98198 1209 aa22.77■■□□□ 1.24
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HOXD11-202ENST00000498438 ZBTB22O15209 634 aa22.73■■□□□ 1.23
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HOXD11-202ENST00000498438 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.72■■□□□ 1.23
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HOXD11-202ENST00000498438 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.72■■□□□ 1.23
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HOXD11-202ENST00000498438 MAP3K11Q16584 847 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXD11-202ENST00000498438 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.69■■□□□ 1.22
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HOXD11-202ENST00000498438 COG6Q9Y2V7 657 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXD11-202ENST00000498438 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.69■■□□□ 1.22
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HOXD11-202ENST00000498438 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.69■■□□□ 1.22
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HOXD11-202ENST00000498438 TNNI3KQ59H18 835 aa22.67■■□□□ 1.22
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HOXD11-202ENST00000498438 GPR108Q9NPR9 543 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXD11-202ENST00000498438 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXD11-202ENST00000498438 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.67■■□□□ 1.22
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HOXD11-202ENST00000498438 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD11-202ENST00000498438 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
HOXD11-202ENST00000498438 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD11-202ENST00000498438 FAM83AQ86UY5 434 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD11-202ENST00000498438 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
HOXD11-202ENST00000498438 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
HOXD11-202ENST00000498438 SPATA5Q8NB90 893 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD11-202ENST00000498438 RNF186Q9NXI6 227 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD11-202ENST00000498438 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD11-202ENST00000498438 MCAMP43121 646 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD11-202ENST00000498438 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.63■■□□□ 1.21
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