RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, human

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SIMC1-208	ENST00000495423	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
SIMC1-208	ENST00000495423	CAP1	Q01518	475 aa		29.24	■■■□□ 2.27
SIMC1-208	ENST00000495423	WDR63	Q8IWG1	891 aa		29.24	■■■□□ 2.27
SIMC1-208	ENST00000495423	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
SIMC1-208	ENST00000495423	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
SIMC1-208	ENST00000495423	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
SIMC1-208	ENST00000495423	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
SIMC1-208	ENST00000495423	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
SIMC1-208	ENST00000495423	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
SIMC1-208	ENST00000495423	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
SIMC1-208	ENST00000495423	GYG1	P46976	350 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	ALDH1L1	O75891	902 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	CRK	P46108	304 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	TNNI2	P48788	182 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	GTF2A2	P52657	109 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	MAP3K9	P80192	1104 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	VGLL4	Q14135	290 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	29.18	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF333	Q96JL9	665 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	ARHGEF6	Q15052	776 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	CCL15	Q16663	113 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	KAZALD1	Q96I82	304 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	CSAD	Q9Y600	493 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SIMC1-208	ENST00000495423	GRIK5	Q16478	980 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	OTUD5	Q96G74	571 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	NBPF11	Q86T75	865 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	SUCLG2	Q96I99	432 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	UTY	O14607	1347 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	AK9	Q5TCS8	1911 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	VPS37D	Q86XT2	251 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	TEKT1	Q969V4	418 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	MRI	Q9BWK5	157 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	FAM83A	Q86UY5	434 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	ERO1B	Q86YB8	467 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF521	Q96K83	1311 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SIMC1-208	ENST00000495423	TLR2	O60603	784 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	CETP	P11597	493 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	CACNB3	P54284	484 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	HOOK2	Q96ED9	719 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	WRNIP1	Q96S55	665 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	BTBD19	C9JJ37	291 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	GNRH1	P01148	92 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	29.04	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	PPIL2	Q13356	520 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	SNAPC2	Q13487	334 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	LRRC24	Q50LG9	513 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	MAST3	O60307	1309 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	IRF6	O14896	467 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	PDE8B	O95263	885 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	KIF22	Q14807	665 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	METTL24	Q5JXM2	366 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
SIMC1-208	ENST00000495423	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		29.03	■■■□□ 2.24

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