RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494546.1

CBX4-203, Transcript of chromobox 4, humanhuman

TSL 3

Gene CBX4, Length 432 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX4-203ENST00000494546 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
CBX4-203ENST00000494546 ADORA1P30542 326 aa41.17■■■■■ 4.18
CBX4-203ENST00000494546 TFCP2Q12800 502 aa41.17■■■■■ 4.18
CBX4-203ENST00000494546 WDR66Q8TBY9 1149 aa41.17■■■■■ 4.18
CBX4-203ENST00000494546 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
CBX4-203ENST00000494546 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa41.17■■■■■ 4.18
CBX4-203ENST00000494546 SPDYE2Q495Y8 402 aa41.16■■■■■ 4.18
CBX4-203ENST00000494546 PHKA1P46020 1223 aa41.15■■■■■ 4.18
CBX4-203ENST00000494546 TIMM10P62072 90 aa41.15■■■■■ 4.18
CBX4-203ENST00000494546 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
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CBX4-203ENST00000494546 ARMC9Q7Z3E5 817 aa41.15■■■■■ 4.18
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CBX4-203ENST00000494546 TEKT1Q969V4 418 aa41.15■■■■■ 4.18
CBX4-203ENST00000494546 C1orf115Q9H7X2 142 aa41.15■■■■■ 4.18
CBX4-203ENST00000494546 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa41.15■■■■■ 4.18
CBX4-203ENST00000494546 TSKSQ9UJT2 592 aa41.14■■■■■ 4.18
CBX4-203ENST00000494546 AKAP2Q9Y2D5 859 aa41.14■■■■■ 4.18
CBX4-203ENST00000494546 RASA3Q14644 834 aa41.13■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 MAST3O60307 1309 aa41.13■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 A0A1B0GUL7 405 aa41.12■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP41.12■■■■■ 4.17
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CBX4-203ENST00000494546 FZD1Q9UP38 647 aa41.12■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 MYH13Q9UKX3 1938 aa41.11■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
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CBX4-203ENST00000494546 CCDC102BQ68D86 513 aa41.11■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 PANK1Q8TE04 598 aa41.11■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 CA12O43570 354 aa41.1■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 DENND2AQ9ULE3 1009 aa41.1■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa41.09■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 TCP10L2B9ZVM9 353 aa41.08■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 SEMA3EO15041 775 aa41.08■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 ATP8B2P98198 1209 aa41.08■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 XAGE2Q96GT9 111 aa41.08■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 NEUROD6Q96NK8 337 aa41.08■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 MRIQ9BWK5 157 aa41.08■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 POLA2Q14181 598 aa41.07■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 ZDHHC15Q96MV8 337 aa41.07■■■■■ 4.17
CBX4-203ENST00000494546 SSC5DA1L4H1 1573 aa41.06■■■■■ 4.16
CBX4-203ENST00000494546 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
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CBX4-203ENST00000494546 SSH3Q8TE77 659 aa41.05■■■■■ 4.16
CBX4-203ENST00000494546 PRDX5P30044 214 aa41.04■■■■■ 4.16
CBX4-203ENST00000494546 MVPQ14764 893 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
CBX4-203ENST00000494546 MS4A1P11836 297 aa41.03■■■■■ 4.16
CBX4-203ENST00000494546 TNNI2P48788 182 aa41.03■■■■■ 4.16
CBX4-203ENST00000494546 CACNB3P54284 484 aa41.03■■■■■ 4.16
CBX4-203ENST00000494546 LDLRAD1Q5T700 205 aa41.03■■■■■ 4.16
CBX4-203ENST00000494546 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
CBX4-203ENST00000494546 CSRNP1Q96S65 589 aa41.03■■■■■ 4.16
CBX4-203ENST00000494546 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
CBX4-203ENST00000494546 LDHBP07195 334 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
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CBX4-203ENST00000494546 RASGRF1Q13972 1273 aa41.02■■■■■ 4.16
CBX4-203ENST00000494546 TMOD2Q9NZR1 351 aa41.02■■■■■ 4.16
CBX4-203ENST00000494546 RCAN3Q9UKA8 241 aa41.02■■■■■ 4.16
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CBX4-203ENST00000494546 DIXDC1Q155Q3 683 aa41■■■■■ 4.15
CBX4-203ENST00000494546 MAP3K11Q16584 847 aa41■■■■■ 4.15
CBX4-203ENST00000494546 TMEM39BQ9GZU3 492 aa41■■■■■ 4.15
CBX4-203ENST00000494546 ZBTB22O15209 634 aa40.98■■■■■ 4.15
CBX4-203ENST00000494546 CDAN1Q8IWY9 1227 aa40.98■■■■■ 4.15
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CBX4-203ENST00000494546 RNF186Q9NXI6 227 aa40.97■■■■■ 4.15
CBX4-203ENST00000494546 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa40.97■■■■■ 4.15
CBX4-203ENST00000494546 SLC10A4Q96EP9 437 aa40.96■■■■■ 4.15
CBX4-203ENST00000494546 USP2O75604 605 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
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CBX4-203ENST00000494546 SAGE1Q9NXZ1 904 aa40.95■■■■■ 4.15
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CBX4-203ENST00000494546 COG6Q9Y2V7 657 aa40.92■■■■■ 4.14
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CBX4-203ENST00000494546 SPRYD7Q5W111 196 aa40.91■■■■■ 4.14
CBX4-203ENST00000494546 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
CBX4-203ENST00000494546 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
CBX4-203ENST00000494546 CAPN15O75808 1086 aa40.9■■■■■ 4.14
CBX4-203ENST00000494546 TNNI3KQ59H18 835 aa40.9■■■■■ 4.14
CBX4-203ENST00000494546 FAM83AQ86UY5 434 aa40.9■■■■■ 4.14
CBX4-203ENST00000494546 GPR108Q9NPR9 543 aa40.9■■■■■ 4.14
CBX4-203ENST00000494546 HMG20BQ9P0W2 317 aa40.9■■■■■ 4.14
CBX4-203ENST00000494546 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa40.9■■■■■ 4.14
CBX4-203ENST00000494546 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
CBX4-203ENST00000494546 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa40.89■■■■■ 4.14
CBX4-203ENST00000494546 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa40.89■■■■■ 4.14
CBX4-203ENST00000494546 UNCXA6NJT0 531 aa40.88■■■■■ 4.13
CBX4-203ENST00000494546 PI16Q6UXB8 463 aa40.88■■■■■ 4.13
CBX4-203ENST00000494546 SPATA5Q8NB90 893 aa40.88■■■■■ 4.13
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