RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493607.1

SERBP1-208, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene SERBP1, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERBP1-208	ENST00000493607	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	RLBP1	P12271	317 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	POLA2	Q14181	598 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SERBP1-208	ENST00000493607	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	UNCX	A6NJT0	531 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	GRIK5	Q16478	980 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	MAP3K11	Q16584	847 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	SSH3	Q8TE77	659 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	TEKT1	Q969V4	418 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	CLRN2	A0PK11	232 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	ATP8B2	P98198	1209 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	CCDC102B	Q68D86	513 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	AOX1	Q06278	1338 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607		A0A1B0GUL7	405 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	PHKA1	P46020	1223 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	TFCP2	Q12800	502 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	28.85	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	VEZT	Q9HBM0	779 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	TIMM10	P62072	90 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	RASA3	Q14644	834 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	ZIC5	Q96T25	663 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	LAMB1	P07942	1786 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	LBX1	P52954	281 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	MOB2	Q70IA6	237 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	GPR108	Q9NPR9	543 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SERBP1-208	ENST00000493607	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	ADORA1	P30542	326 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	TNNI2	P48788	182 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	XAGE2	Q96GT9	111 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	FAM83A	Q86UY5	434 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	TNS4	Q8IZW8	715 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	TEPSIN	Q96N21	525 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	PANK1	Q8TE04	598 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	CSRNP1	Q96S65	589 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	PRDX5	P30044	214 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	RASGRF1	Q13972	1273 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		28.77	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.2
SERBP1-208	ENST00000493607	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		28.76	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	CEP85	Q6P2H3	762 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	OTOF	Q9HC10	1997 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	TM4SF4	P48230	202 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	PRKG1	Q13976	671 aa		28.73	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	GAK	O14976	1311 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	TNNI3K	Q59H18	835 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	SLF2	Q8IX21	1173 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	HOOK2	Q96ED9	719 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	GORAB	Q5T7V8	394 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	SPRYD7	Q5W111	196 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	RNF186	Q9NXI6	227 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		28.7	■■■□□ 2.19
SERBP1-208	ENST00000493607	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
SERBP1-208	ENST00000493607	PDE3A	Q14432	1141 aa		28.7	■■■□□ 2.18

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms