RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 SRGAP3O43295 1099 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 MTX1Q13505 466 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 GNAI2P04899 355 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 RASA3Q14644 834 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 CSRNP1Q96S65 589 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRU-207ENST00000492954 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 ADORA1P30542 326 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 PHKA1P46020 1223 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 TNFAIP1Q13829 316 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 TEKT1Q969V4 418 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 RNF186Q9NXI6 227 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 TRPA1O75762 1119 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 MAST3O60307 1309 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 TFCP2Q12800 502 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 RLBP1P12271 317 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 TIMM10P62072 90 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 MAP3K11Q16584 847 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 MRIQ9BWK5 157 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 CACNB3P54284 484 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 CCDC102BQ68D86 513 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 TEPSINQ96N21 525 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 A0A1B0GUL7 405 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 PRDX5P30044 214 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-207ENST00000492954 SEMA3EO15041 775 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 TNNI2P48788 182 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 SPRYD7Q5W111 196 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 XAGE2Q96GT9 111 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 TM4SF4P48230 202 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 RASGRF1Q13972 1273 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 ZBTB22O15209 634 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 POLA2Q14181 598 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 ABHD8Q96I13 439 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 WNK4Q96J92 1243 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 UNCXA6NJT0 531 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 ATP8B2P98198 1209 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 SREBF2Q12772 1141 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 FAM83AQ86UY5 434 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 PANK1Q8TE04 598 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 SSH3Q8TE77 659 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRU-207ENST00000492954 TBC1D8O95759 1140 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 GJA5P36382 358 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 DGKZQ13574 1117 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 GORABQ5T7V8 394 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 ELP3Q9H9T3 547 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 ABCF2Q9UG63 623 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.152e-6■■□□□ 12
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