RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRVP-202ENST00000490575 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRVP-202ENST00000490575 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRVP-202ENST00000490575 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRVP-202ENST00000490575 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRVP-202ENST00000490575 RASSF10A6NK89 507 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 ZBTB22O15209 634 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 MOB2Q70IA6 237 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 FZD1Q9UP38 647 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 VEGFBP49765 207 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 MMP14P50281 582 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 SEMA3EO15041 775 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 CACNB3P54284 484 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 SNRKQ9NRH2 765 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 JMYQ8N9B5 988 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 GORABQ5T7V8 394 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 SPATA5Q8NB90 893 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 VEZTQ9HBM0 779 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 AACSQ86V21 672 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 TEKT1Q969V4 418 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 MRIQ9BWK5 157 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 BCL11AQ9H165 835 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 ABCF2Q9UG63 623 aa20.02■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PTPRVP-202ENST00000490575 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 HMMRO75330 724 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 ZIC5Q96T25 663 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 ZAP70P43403 619 aa20■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 RASA3Q14644 834 aa20■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 TTC39AQ5SRH9 613 aa20■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 ERC1Q8IUD2 1116 aa20■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 KIF1BPQ96EK5 621 aa20■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 TEPSINQ96N21 525 aa20■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 THSD7BQ9C0I4 1608 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 AOC2O75106 756 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 HUNKP57058 714 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 MECOMQ03112 1051 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 PRKG1Q13976 671 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 EXOC6Q8TAG9 804 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 TMEM39BQ9GZU3 492 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 DCTPP1Q9H773 170 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 UBE2Q2LH0YL09 131 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 GRM1Q13255 1194 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 CCDC158Q5M9N0 1113 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 CAPNS2Q96L46 248 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 ANTXR1Q9H6X2 564 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 GAKO14976 1311 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 MYO1BO43795 1136 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 RAB11FIP3O75154 756 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 NFIAQ12857 509 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 C2orf69Q8N8R5 385 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 MAST3O60307 1309 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 ADGRA1Q86SQ6 560 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 ZFPM1Q8IX07 1006 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 DOCK2Q92608 1830 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRVP-202ENST00000490575 MAST2Q6P0Q8 1798 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRVP-202ENST00000490575 OTOFQ9HC10 1997 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRVP-202ENST00000490575 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms