RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-208ENST00000490302 ARMC5Q96C12 935 aa21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 MAP3K9P80192 1104 aa21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 SUCLG2Q96I99 432 aa21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 GTF2A2P52657 109 aa21.96■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 VPS37DQ86XT2 251 aa21.96■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.96■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.96■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.96■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 CSADQ9Y600 493 aa21.96■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.95■■□□□ 1.11
PKDCC-208ENST00000490302 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.95■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 CAP1Q01518 475 aa21.95■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 VGLL4Q14135 290 aa21.95■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 ARHGEF6Q15052 776 aa21.95■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 CCL15Q16663 113 aa21.95■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.95■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.15e-7■■□□□ 11.6
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PKDCC-208ENST00000490302 OTOFQ9HC10 1997 aa21.94■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 GRIK5Q16478 980 aa21.93■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.93■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 OTUD5Q96G74 571 aa21.93■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.93■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
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PKDCC-208ENST00000490302 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.92■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.92■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.92■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.91■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 TEKT1Q969V4 418 aa21.91■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.9■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 UTYO14607 1347 aa21.9■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 METTL24Q5JXM2 366 aa21.9■■□□□ 1.1
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PKDCC-208ENST00000490302 ZNF333Q96JL9 665 aa21.9■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 CACNB3P54284 484 aa21.89■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.89■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 LRRC24Q50LG9 513 aa21.89■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.89■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.89■■□□□ 1.1
PKDCC-208ENST00000490302 ANP32CO43423 234 aa21.89■■□□□ 1.09
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PKDCC-208ENST00000490302 ERO1BQ86YB8 467 aa21.88■■□□□ 1.09
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PKDCC-208ENST00000490302 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.88■■□□□ 1.09
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PKDCC-208ENST00000490302 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.88■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 FAM83AQ86UY5 434 aa21.87■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 MAST3O60307 1309 aa21.86■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 TLR2O60603 784 aa21.86■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 BCAMP50895 628 aa21.86■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 KIF22Q14807 665 aa21.86■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.86■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.86■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.86■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 SNAPC2Q13487 334 aa21.85■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.85■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.85■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 HTTP42858 3142 aa21.84■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 BTBD19C9JJ37 291 aa21.84■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 PPIL2Q13356 520 aa21.84■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 DCAF15Q66K64 600 aa21.84■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PKDCC-208ENST00000490302 IRF6O14896 467 aa21.83■■□□□ 1.09
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PKDCC-208ENST00000490302 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.83■■□□□ 1.09
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PKDCC-208ENST00000490302 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.82■■□□□ 1.08
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.82■■□□□ 1.08
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PKDCC-208ENST00000490302 GNRH1P01148 92 aa21.81■■□□□ 1.08
PKDCC-208ENST00000490302 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PKDCC-208ENST00000490302 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.81■■□□□ 1.08
PKDCC-208ENST00000490302 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PKDCC-208ENST00000490302 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.81■■□□□ 1.08
PKDCC-208ENST00000490302 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PKDCC-208ENST00000490302 FGFR2P21802 821 aa21.8■■□□□ 1.08
PKDCC-208ENST00000490302 PRMT2P55345 433 aa21.8■■□□□ 1.08
PKDCC-208ENST00000490302 PPATQ06203 517 aa21.8■■□□□ 1.08
PKDCC-208ENST00000490302 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.8■■□□□ 1.08
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