RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 CRKP46108 304 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 CAP1Q01518 475 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 ERO1AQ96HE7 468 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 TEPSINQ96N21 525 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 LRRC24Q50LG9 513 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 SP3Q02447 781 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 VPS37DQ86XT2 251 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 EFCC1Q9HA90 598 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 CACNB3P54284 484 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 TNNI2P48788 182 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 MAP3K9P80192 1104 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 BRCA2P51587 3418 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRN-217ENST00000489650 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 VGLL4Q14135 290 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 CCL15Q16663 113 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 METTL24Q5JXM2 366 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 UTYO14607 1347 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 BCAMP50895 628 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 OTUD5Q96G74 571 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 CSADQ9Y600 493 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 PDE8BO95263 885 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 EN2P19622 333 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 GTF2A2P52657 109 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 TEKT1Q969V4 418 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 ARMC5Q96C12 935 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRN-217ENST00000489650 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 WRNIP1Q96S55 665 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 MYCP01106 439 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 TMEM106CQ9BVX2 250 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 USP44Q9H0E7 712 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF521Q96K83 1311 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 FGFR2P21802 821 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 ERO1BQ86YB8 467 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF333Q96JL9 665 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 MRIQ9BWK5 157 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 BTBD19C9JJ37 291 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 IRF6O14896 467 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 CETPP11597 493 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 ARHGEF6Q15052 776 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 FAM83AQ86UY5 434 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 GCC1Q96CN9 775 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 PTPRCP08575 1304 aa23.14■■□□□ 1.3
PTPRN-217ENST00000489650 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 NBPF11Q86T75 865 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 TLR2O60603 784 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 SNAPC2Q13487 334 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 MAST3O60307 1309 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 AK9Q5TCS8 1911 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 EYA2O00167 538 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRN-217ENST00000489650 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
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