RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 CAVIN4Q5BKX8 364 aa28.12■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 CDAN1Q8IWY9 1227 aa28.12■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 GJA5P36382 358 aa28.11■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 IREB2P48200 963 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 INHBEP58166 350 aa28.11■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 IFNL1Q8IU54 200 aa28.11■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 TEPSINQ96N21 525 aa28.11■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 HPS5Q9UPZ3 1129 aa28.11■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 FGFR2P21802 821 aa28.1■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 TNFAIP1Q13829 316 aa28.1■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.1■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.09■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 FKTNO75072 461 aa28.09■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 ALDH1A1P00352 501 aa28.08■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa28.08■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa28.08■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 TMEM39BQ9GZU3 492 aa28.08■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 LAMB1P07942 1786 aa28.08■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa28.08■■■□□ 2.09
POLR2F-211ENST00000488684 EYA2O00167 538 aa28.07■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 OTOFQ9HC10 1997 aa28.06■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 ATG9AQ7Z3C6 839 aa28.05■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 ELP3Q9H9T3 547 aa28.05■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 KIF16BQ96L93 1317 aa28.04■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 CACNB3P54284 484 aa28.04■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 TEKT1Q969V4 418 aa28.04■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 PTPN18Q99952 460 aa28.04■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 TNNI2P48788 182 aa28.03■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 MRIQ9BWK5 157 aa28.03■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 HTTP42858 3142 aa28.03■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 ZDHHC15Q96MV8 337 aa28.02■■■□□ 2.08
POLR2F-211ENST00000488684 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa28.01■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 LPIN2Q92539 896 aa28.01■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 OPTNQ96CV9 577 aa28.01■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa28.01■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 SLC5A1P13866 664 aa28■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 MAP3K9P80192 1104 aa28■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 MS4A4AQ96JQ5 239 aa28■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 SIL1Q9H173 461 aa28■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 VGLL4Q14135 290 aa27.99■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP27.99■■■□□ 2.072e-8■■□□□ 13.3
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POLR2F-211ENST00000488684 HHIPL2Q6UWX4 724 aa27.98■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa27.97■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 MAST3O60307 1309 aa27.96■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 CIAO1O76071 339 aa27.96■■■□□ 2.07
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POLR2F-211ENST00000488684 FAM83AQ86UY5 434 aa27.96■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 WDR66Q8TBY9 1149 aa27.96■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 FBXO3Q9UK99 471 aa27.96■■■□□ 2.07
POLR2F-211ENST00000488684 MYH13Q9UKX3 1938 aa27.96■■■□□ 2.07
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POLR2F-211ENST00000488684 OTOP1Q7RTM1 612 aa27.95■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 BRI3BPQ8WY22 251 aa27.95■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 CEP126Q9P2H0 1117 aa27.95■■■□□ 2.06
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POLR2F-211ENST00000488684 TRIM17Q9Y577 477 aa27.95■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 CCER2I3L3R5 266 aa27.94■■■□□ 2.06
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POLR2F-211ENST00000488684 ATP2B3Q16720 1220 aa27.94■■■□□ 2.06
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POLR2F-211ENST00000488684 MEIS3Q99687 375 aa27.93■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 CAP1Q01518 475 aa27.92■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 DIXDC1Q155Q3 683 aa27.92■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 CD99L2Q8TCZ2 262 aa27.92■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 OTUD5Q96G74 571 aa27.92■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa27.92■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa27.91■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 PRDX5P30044 214 aa27.91■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 GTF2A2P52657 109 aa27.91■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 CCL15Q16663 113 aa27.91■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 ERO1AQ96HE7 468 aa27.91■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa27.91■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 SPDYE5A6NIY4 337 aa27.9■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 IL15P40933 162 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 PHKA1P46020 1223 aa27.9■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 WRNIP1Q96S55 665 aa27.9■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 COPRSQ9NQ92 184 aa27.9■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 SP3Q02447 781 aa27.89■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa27.89■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 FAM43AQ8N2R8 423 aa27.89■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 HDAC5Q9UQL6 1122 aa27.89■■■□□ 2.06
POLR2F-211ENST00000488684 ADORA1P30542 326 aa27.88■■■□□ 2.05
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