RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487620.1

ZNF3-215, Transcript of zinc finger protein 3, human

TSL 2

Gene ZNF3, Length 2,660 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF3-215	ENST00000487620	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	NBPF15	Q8N660	670 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	FOXP2	O15409	715 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	SERPINC1	P01008	464 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	CMA1	P23946	247 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	ADORA1	P30542	326 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	PTPN21	Q16825	1174 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	NCOA7	Q8NI08	942 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	AIFM3	Q96NN9	605 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	DNAI1	Q9UI46	699 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	SYK	P43405	635 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	ANTXR2	P58335	489 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	CHRNA2	Q15822	529 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	FBXL16	Q8N461	479 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	11.32	□□□□□ -0.6	1e-6	■■□□□ 12.4
ZNF3-215	ENST00000487620	ZNF213	O14771	459 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	RXRA	P19793	462 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	UBASH3A	P57075	661 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	CFAP100	Q494V2	611 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	PI16	Q6UXB8	463 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	11.31	□□□□□ -0.6	2e-6	■□□□□ 9.6
ZNF3-215	ENST00000487620	SPEF2	Q9C093	1822 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	A1BG	P04217	495 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	PNOC	Q13519	176 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	SCARF1	Q14162	830 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	CCDC93	Q567U6	631 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	DPF2	Q92785	391 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	XAGE2	Q96GT9	111 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	IKBKB	O14920	756 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	ZAP70	P43403	619 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	SLC39A14	Q15043	492 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	TICAM2	Q86XR7	235 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	TJP1	Q07157	1748 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	ERICH4	A6NGS2	130 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	KCNJ6	P48051	423 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	CLCN6	P51797	869 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	VPS37D	Q86XT2	251 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	ALG1	Q9BT22	464 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.3	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	GPAA1	O43292	621 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	CIAO1	O76071	339 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	MYL5	Q02045	173 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	TRDN	Q13061	729 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	MNS1	Q8NEH6	495 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	PHKB	Q93100	1093 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	CLIC6	Q96NY7	704 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	C4A	P0C0L4	1744 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	C4B	P0C0L5	1744 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	CCP110	O43303	1012 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	SHC4	Q6S5L8	630 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	UBXN4	Q92575	508 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	APPBP2	Q92624	585 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	MYH7	P12883	1935 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	TMEM232	C9JQI7	657 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	CBFA2T2	O43439	604 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	APP	P05067	770 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	KRT40	Q6A162	431 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	OLFM4	Q6UX06	510 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	MICU3	Q86XE3	530 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	TUBB4A	P04350	444 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF3-215	ENST00000487620	TAF3	Q5VWG9	929 aa		11.28	□□□□□ -0.6

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