RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 XDHP47989 1333 aa12.34□□□□□ -0.43
GTPBP1-211ENST00000487538 BBOX1O75936 387 aa12.33□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 KLRK1P26718 216 aa12.33□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 STOX1Q6ZVD7 989 aa12.33□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 AIDAQ96BJ3 306 aa12.33□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 GBP4Q96PP9 640 aa12.33□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 IRS2Q9Y4H2 1338 aa12.33□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 SLX4Q8IY92 1834 aa12.32□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 FGAP02671 866 aa12.32□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 PRELPP51888 382 aa12.32□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 C1QTNF8P60827 252 aa12.32□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 TTLL5Q6EMB2 1281 aa12.32□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 TMC4Q7Z404 712 aa12.32□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 C2CD5Q86YS7 1000 aa12.32□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 BRIP1Q9BX63 1249 aa12.32□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 ZMYM6O95789 1325 aa12.32□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 E7EWF7 191 aa12.31□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 MBD4O95243 580 aa12.31□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 GNAT2P19087 354 aa12.31□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 MCM4P33991 863 aa12.31□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 RASSF7Q02833 373 aa12.31□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 ALX1Q15699 326 aa12.31□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa12.31□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 RAI14Q9P0K7 980 aa12.31□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 ABCF2Q9UG63 623 aa12.31□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 TPCN1Q9ULQ1 816 aa12.31□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 LRRC37AA6NMS7 1700 aa12.31□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 SNED1Q8TER0 1413 aa12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 DDX11L8A8MPP1 907 aa12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 NFKBIEO00221 500 aa12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF213O14771 459 aa12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 LARGE1O95461 756 aa12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 APPP05067 770 aa12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 NPR1P16066 1061 aa12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP7A1P22680 504 aa12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP2B4P23634 1241 aa12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 PDE6BP35913 854 aa12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 GPSM2P81274 684 aa12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 ME3Q16798 604 aa12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF804AQ7Z570 1209 aa12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 TCEANC2Q96MN5 208 aa12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 MAST2Q6P0Q8 1798 aa12.3□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 MYH13Q9UKX3 1938 aa12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 H0YIN7 160 aa12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF3CO14782 793 aa12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 IGSF3O75054 1194 aa12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 UFL1O94874 794 aa12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 FGD1P98174 961 aa12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 C9orf131Q5VYM1 1079 aa12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 CLEC17AQ6ZS10 378 aa12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 Q6ZUG5 572 aa12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC83Q8IWF9 413 aa12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 TTLL6Q8N841 843 aa12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 NACAP1Q9BZK3 213 aa12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 ARMT1Q9H993 441 aa12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 PODXL2Q9NZ53 605 aa12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 GGA1Q9UJY5 639 aa12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 SMC3Q9UQE7 1217 aa12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 LAMA4Q16363 1823 aa12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 DUOX1Q9NRD9 1551 aa12.29□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa12.28□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa12.28□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 SRGNP10124 158 aa12.28□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 PTMSP20962 102 aa12.28□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 HAND2P61296 217 aa12.28□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 PKP1Q13835 747 aa12.28□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC51AQ86UW1 340 aa12.28□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 TXNRD3Q86VQ6 643 aa12.28□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 SP8Q8IXZ3 490 aa12.28□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 LCORLQ8N3X6 602 aa12.28□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 NAPBQ9H115 298 aa12.28□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 SALL1Q9NSC2 1324 aa12.28□□□□□ -0.44
GTPBP1-211ENST00000487538 BRD1O95696 1058 aa12.27□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 ST3GAL1Q11201 340 aa12.27□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 IFNL3Q8IZI9 196 aa12.27□□□□□ -0.45
GTPBP1-211ENST00000487538 NECAB1Q8N987 351 aa12.27□□□□□ -0.45
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