RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 EYA2O00167 538 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 MAST3O60307 1309 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 BCAMP50895 628 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 TEKT1Q969V4 418 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.16■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 KIF16BQ96L93 1317 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 WNK4Q96J92 1243 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 AOX1Q06278 1338 aa25.14■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.14■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 GPR25O00155 361 aa25.14■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 LPIN2Q92539 896 aa25.14■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 FBXO3Q9UK99 471 aa25.14■■□□□ 1.62
ACTB-212ENST00000484841 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 RGS19P49795 217 aa25.13■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.13■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.13■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.13■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 SIL1Q9H173 461 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 FKTNO75072 461 aa25.11■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 FGFR2P21802 821 aa25.11■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.11■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 CIAO1O76071 339 aa25.1■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 GRIK5Q16478 980 aa25.1■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 IFNL1Q8IU54 200 aa25.1■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 MRIQ9BWK5 157 aa25.1■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.1■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 HOOK2Q96ED9 719 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 ZDHHC15Q96MV8 337 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 ATP2B3Q16720 1220 aa25.08■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.08■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 ELP3Q9H9T3 547 aa25.08■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 CSADQ9Y600 493 aa25.08■■□□□ 1.61
ACTB-212ENST00000484841 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 LAMB1P07942 1786 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 OTOFQ9HC10 1997 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 GNAI3P08754 354 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 MAP3K9P80192 1104 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 OPTNQ96CV9 577 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 TEPSINQ96N21 525 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 CACNB3P54284 484 aa25.05■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.05■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 SOX10P56693 466 aa25.04■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 FAM83AQ86UY5 434 aa25.04■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 MEIS3Q99687 375 aa25.04■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 AK9Q5TCS8 1911 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 SEMA3EO15041 775 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 DCAF15Q66K64 600 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 COPRSQ9NQ92 184 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ACTB-212ENST00000484841 GJA5P36382 358 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 VGLL4Q14135 290 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 SRGAP3O43295 1099 aa25■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 GTF2A2P52657 109 aa25■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 OTUD5Q96G74 571 aa25■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 ERO1AQ96HE7 468 aa25■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 WRNIP1Q96S55 665 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 TRIM17Q9Y577 477 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 CRHR2Q13324 411 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 PHKA1P46020 1223 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 CCL15Q16663 113 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 FAM151AQ8WW52 585 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
ACTB-212ENST00000484841 SALL1Q9NSC2 1324 aa24.96■■□□□ 1.59
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