RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 VEZTQ9HBM0 779 aa29.75■■■□□ 2.35
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PTPRD-210ENST00000481079 ADORA1P30542 326 aa29.74■■■□□ 2.35
PTPRD-210ENST00000481079 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
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PTPRD-210ENST00000481079 MRIQ9BWK5 157 aa29.74■■■□□ 2.35
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PTPRD-210ENST00000481079 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
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PTPRD-210ENST00000481079 FZD1Q9UP38 647 aa29.72■■■□□ 2.35
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PTPRD-210ENST00000481079 TNNI2P48788 182 aa29.59■■■□□ 2.33
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PTPRD-210ENST00000481079 FAM83AQ86UY5 434 aa29.58■■■□□ 2.33
PTPRD-210ENST00000481079 RCAN3Q9UKA8 241 aa29.58■■■□□ 2.33
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PTPRD-210ENST00000481079 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
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PTPRD-210ENST00000481079 TMOD2Q9NZR1 351 aa29.55■■■□□ 2.32
PTPRD-210ENST00000481079 MYH2Q9UKX2 1941 aa29.55■■■□□ 2.32
PTPRD-210ENST00000481079 GAKO14976 1311 aa29.54■■■□□ 2.32
PTPRD-210ENST00000481079 TNNI3KQ59H18 835 aa29.54■■■□□ 2.32
PTPRD-210ENST00000481079 PI16Q6UXB8 463 aa29.54■■■□□ 2.32
PTPRD-210ENST00000481079 WNK4Q96J92 1243 aa29.54■■■□□ 2.32
PTPRD-210ENST00000481079 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa29.54■■■□□ 2.32
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