RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 CLMNQ96JQ2 1002 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 MEIS3Q99687 375 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 TMOD2Q9NZR1 351 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 CEP126Q9P2H0 1117 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 HDAC5Q9UQL6 1122 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 FAM205AQ6ZU69 1335 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 ARAP2Q8WZ64 1704 aa10.05□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 IREB2P48200 963 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 TNNI2P48788 182 aa10.05□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 RARSP54136 660 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 TNFAIP1Q13829 316 aa10.05□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 GRIK5Q16478 980 aa10.05□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 ATP2B3Q16720 1220 aa10.05□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 FBXO33Q7Z6M2 555 aa10.05□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa10.05□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 TEKT1Q969V4 418 aa10.05□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM39BQ9GZU3 492 aa10.05□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 SERPINA10Q9UK55 444 aa10.05□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 KIF16BQ96L93 1317 aa10.05□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 SRGAP3O43295 1099 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 BCAR3O75815 825 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 SREBF2Q12772 1141 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 SPDYE2Q495Y8 402 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 SPRYD7Q5W111 196 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 MTMR14Q8NCE2 650 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 LPIN2Q92539 896 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 NEUROD6Q96NK8 337 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 ELP3Q9H9T3 547 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 SAGE1Q9NXZ1 904 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 TNNQ9UQP3 1299 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 GNAI3P08754 354 aa10.03□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 GORABQ5T7V8 394 aa10.03□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.03□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 VGLL2Q8N8G2 317 aa10.03□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 WNK4Q96J92 1243 aa10.03□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 BCL11AQ9H165 835 aa10.03□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CTPS1-209ENST00000480420 USP2O75604 605 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 IL15P40933 162 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 SOX10P56693 466 aa10.02□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 TCP10Q12799 353 aa10.02□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 LDLRAD1Q5T700 205 aa10.02□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 ATG9AQ7Z3C6 839 aa10.02□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa10.02□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 WDR66Q8TBY9 1149 aa10.02□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 CSADQ9Y600 493 aa10.02□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 MAST3O60307 1309 aa10.02□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 OTOFQ9HC10 1997 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 LDHBP07195 334 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM27P14373 513 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 ADORA1P30542 326 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 TM4SF4P48230 202 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 TIMM10P62072 90 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 DIXDC1Q155Q3 683 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 MIGA2Q7L4E1 593 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 OPTNQ96CV9 577 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 ABCF2Q9UG63 623 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 MYH2Q9UKX2 1941 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 SSC5DA1L4H1 1573 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 GPR25O00155 361 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 CIAO1O76071 339 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 GNAI2P04899 355 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 FGFR2P21802 821 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 PHKA1P46020 1223 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 TFCP2Q12800 502 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 IFNL1Q8IU54 200 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGAP45Q92619 1136 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 OTUD5Q96G74 571 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 DENND2AQ9ULE3 1009 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 FKTNO75072 461 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 ALDH1A1P00352 501 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 PRDX5P30044 214 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 MAP3K9P80192 1104 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 ITPRIPQ8IWB1 547 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-209ENST00000480420 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
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