RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 EFCC1Q9HA90 598 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 PRDM6Q9NQX0 595 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 FBXO3Q9UK99 471 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 CIAO1O76071 339 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 CRHR2Q13324 411 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 ATG9AQ7Z3C6 839 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 DPF3Q92784 378 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 ERO1AQ96HE7 468 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 POLLQ9UGP5 575 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 MINPP1Q9UNW1 487 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 SPEF2Q9C093 1822 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 SURF6O75683 361 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 VIL1P09327 827 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 IL15P40933 162 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 PRKG1Q13976 671 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 WASHC4Q2M389 1173 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 LRRC24Q50LG9 513 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 SH3TC2Q8TF17 1288 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 SIL1Q9H173 461 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 DCTPP1Q9H773 170 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 CNNM1Q9NRU3 951 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 ALPK3Q96L96 1907 aa13.27□□□□□ -0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 IGHDP01880 384 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP13.27□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 DEFB123Q8N688 67 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 SSC5DA1L4H1 1573 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 ALDH1A1P00352 501 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 GPSM2P81274 684 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 CHRNDQ07001 517 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 NBPF9Q3BBW0 867 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 LDLRAD1Q5T700 205 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 MROH5Q6ZUA9 1318 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 ANKRD2Q9GZV1 360 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 RAB11FIP3O75154 756 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 GJA5P36382 358 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 METTL24Q5JXM2 366 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 CLMNQ96JQ2 1002 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 GMLQ99445 158 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 PTPN18Q99952 460 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 MYOZ2Q9NPC6 264 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 MTMR10Q9NXD2 777 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 PODXL2Q9NZ53 605 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 XDHP47989 1333 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A1W2PPC1 479 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 TAF5LO75529 589 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 SASH1O94885 1247 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 SP3Q02447 781 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 MTFR1Q15390 333 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 ERC1Q8IUD2 1116 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 VGLL2Q8N8G2 317 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 PPP4R2Q9NY27 417 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 CEP126Q9P2H0 1117 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 STAP2Q9UGK3 403 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 PDE8BO95263 885 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 COL9A1P20849 921 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 ATP2B4P23634 1241 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 TFCP2Q12800 502 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 RHPN1Q8TCX5 695 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 LEMD3Q9Y2U8 911 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 OTOFQ9HC10 1997 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 C6orf229H3BNL8 230 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 SMC5Q8IY18 1101 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 TBC1D16Q8TBP0 767 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 WNK4Q96J92 1243 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 GPR108Q9NPR9 543 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 GGA1Q9UJY5 639 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A1B0GUL6 1792 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF804BA4D1E1 1349 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 APBB1O00213 710 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 FGFR2P21802 821 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 UBE4AQ14139 1066 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 KIF1BPQ96EK5 621 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC136Q96JN2 1154 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 LRRCC1Q9C099 1032 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66 ms