RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471494.5

RNF220-208, Transcript of ring finger protein 220, human

TSL 5

Gene RNF220, Length 720 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF220-208	ENST00000471494	GRIK5	Q16478	980 aa		29.09	■■■□□ 2.25
RNF220-208	ENST00000471494	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
RNF220-208	ENST00000471494	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		29.09	■■■□□ 2.25
RNF220-208	ENST00000471494	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		29.09	■■■□□ 2.25
RNF220-208	ENST00000471494	TNFAIP1	Q13829	316 aa		29.08	■■■□□ 2.25
RNF220-208	ENST00000471494	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		29.08	■■■□□ 2.25
RNF220-208	ENST00000471494	MAST3	O60307	1309 aa		29.08	■■■□□ 2.25
RNF220-208	ENST00000471494	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	TEKT1	Q969V4	418 aa		29.07	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		29.07	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		29.06	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	CAPN15	O75808	1086 aa		29.06	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		29.06	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		29.06	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	RASA3	Q14644	834 aa		29.05	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	CSRNP1	Q96S65	589 aa		29.04	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		29.04	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	TNNI2	P48788	182 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	FZD1	Q9UP38	647 aa		29.02	■■■□□ 2.24
RNF220-208	ENST00000471494	PHKA1	P46020	1223 aa		29.01	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		29.01	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	OTOF	Q9HC10	1997 aa		29.01	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		29	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	SEMA3E	O15041	775 aa		29	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	ADORA1	P30542	326 aa		29	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	TFCP2	Q12800	502 aa		29	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	MAP3K11	Q16584	847 aa		29	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	MRI	Q9BWK5	157 aa		29	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	RNF186	Q9NXI6	227 aa		29	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		29	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	TRPA1	O75762	1119 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		28.99	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494		A0A1B0GUL7	405 aa		28.98	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	CCDC102B	Q68D86	513 aa		28.98	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	TIMM10	P62072	90 aa		28.97	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		28.97	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	LAMB1	P07942	1786 aa		28.96	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	28.96	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		28.96	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		28.96	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		28.96	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		28.95	■■■□□ 2.23
RNF220-208	ENST00000471494	UNCX	A6NJT0	531 aa		28.95	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	RLBP1	P12271	317 aa		28.95	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	CACNB3	P54284	484 aa		28.95	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	SPRYD7	Q5W111	196 aa		28.95	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	TEPSIN	Q96N21	525 aa		28.95	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	ZBTB22	O15209	634 aa		28.94	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	PRDX5	P30044	214 aa		28.94	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	SREBF2	Q12772	1141 aa		28.94	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	XAGE2	Q96GT9	111 aa		28.94	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		28.94	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	AK9	Q5TCS8	1911 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	RASGRF1	Q13972	1273 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		28.93	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		28.92	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		28.92	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		28.92	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	TM4SF4	P48230	202 aa		28.91	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	GORAB	Q5T7V8	394 aa		28.91	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	FAM83A	Q86UY5	434 aa		28.91	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		28.91	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	ATP8B2	P98198	1209 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	POLA2	Q14181	598 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	ABHD8	Q96I13	439 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	WNK4	Q96J92	1243 aa		28.9	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	SSH3	Q8TE77	659 aa		28.89	■■■□□ 2.22
RNF220-208	ENST00000471494	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
RNF220-208	ENST00000471494	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
RNF220-208	ENST00000471494	HOOK2	Q96ED9	719 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RNF220-208	ENST00000471494	ABCF2	Q9UG63	623 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RNF220-208	ENST00000471494	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
RNF220-208	ENST00000471494	PANK1	Q8TE04	598 aa		28.87	■■■□□ 2.21

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