RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469728.5

RTEL1-208, Transcript of regulator of telomere elongation helicase 1, human

TSL 3

Gene RTEL1, Length 601 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RTEL1-208	ENST00000469728	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	AOX1	Q06278	1338 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	LRRC24	Q50LG9	513 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	MAST3	O60307	1309 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	SLFN5	Q08AF3	891 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	USP44	Q9H0E7	712 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	HOOK2	Q96ED9	719 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTEL1-208	ENST00000469728	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	FGFR2	P21802	821 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	GJA5	P36382	358 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	FAM83A	Q86UY5	434 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	HTT	P42858	3142 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	EYA2	O00167	538 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	LPIN2	Q92539	896 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	ELP3	Q9H9T3	547 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	TRIM17	Q9Y577	477 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	OTOF	Q9HC10	1997 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	SLC5A1	P13866	664 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	BCAM	P50895	628 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	GTF2A2	P52657	109 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	CRHR2	Q13324	411 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	GRIK5	Q16478	980 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	PTPN18	Q99952	460 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	ZBTB22	O15209	634 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	SP3	Q02447	781 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	VGLL4	Q14135	290 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	CENPF	P49454	3210 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	CIAO1	O76071	339 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	CCL15	Q16663	113 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	DCAF15	Q66K64	600 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RTEL1-208	ENST00000469728	SEMA3E	O15041	775 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RTEL1-208	ENST00000469728	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RTEL1-208	ENST00000469728	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RTEL1-208	ENST00000469728	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RTEL1-208	ENST00000469728	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RTEL1-208	ENST00000469728	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RTEL1-208	ENST00000469728	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RTEL1-208	ENST00000469728	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RTEL1-208	ENST00000469728	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RTEL1-208	ENST00000469728	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RTEL1-208	ENST00000469728	CETP	P11597	493 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RTEL1-208	ENST00000469728	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RTEL1-208	ENST00000469728	CACNB3	P54284	484 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RTEL1-208	ENST00000469728	PPIL2	Q13356	520 aa		13.63	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms