RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 LIG1P18858 919 aa16.2■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 CYP2C19P33261 490 aa16.2■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 CCDC144BQ3MJ40 725 aa16.2■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 NYAP1Q6ZVC0 841 aa16.2■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa16.2■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa16.2■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 CLIP2Q9UDT6 1046 aa16.2■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa16.2■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 COL4A1P02462 1669 aa16.2■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 M0R2C6 588 aa16.2■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 ELF2Q15723 593 aa16.2■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 TTC6Q86TZ1 520 aa16.2■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 KCNB2Q92953 911 aa16.2■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 OSBP2Q969R2 916 aa16.2■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 MAST3O60307 1309 aa16.19■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 PTPN14Q15678 1187 aa16.19■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 ZNF446Q9NWS9 450 aa16.19■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 CYP21A2P08686 494 aa16.19■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 WASHC4Q2M389 1173 aa16.19■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 LRRC8AQ8IWT6 810 aa16.19■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 CKAP2LQ8IYA6 745 aa16.19■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 TNMDQ9H2S6 317 aa16.19■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa16.19■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 USP27XA6NNY8 438 aa16.18■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 CDC25BP30305 580 aa16.18■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 CCDC152Q4G0S7 254 aa16.18■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa16.18■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 CCDC102BQ68D86 513 aa16.18■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 TSPYL1Q9H0U9 437 aa16.18■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 LRRC4BQ9NT99 713 aa16.18■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 BTAF1O14981 1849 aa16.18■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.18■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 MYH3P11055 1940 aa16.18■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 ELP1O95163 1332 aa16.18■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 RREB1Q92766 1687 aa16.18■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 TTLL5Q6EMB2 1281 aa16.17■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 RPS6KA4O75676 772 aa16.17■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 KRT85P78386 507 aa16.17■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 RNF20Q5VTR2 975 aa16.17■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 FAM173BQ6P4H8 233 aa16.17■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 CLEC4GQ6UXB4 293 aa16.17■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 DACT1Q9NYF0 836 aa16.17■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 NEMFO60524 1076 aa16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 FERMT3Q86UX7 667 aa16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 LRRC2Q9BYS8 371 aa16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 TPCN1Q9ULQ1 816 aa16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 ABCC12Q96J65 1359 aa16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 ZPR1O75312 459 aa16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 SLU7O95391 586 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 ZNF165P49910 485 aa16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 IDH1O75874 414 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 ST3GAL1Q11201 340 aa16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 ME3Q16798 604 aa16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 FAM196AQ6ZSG2 479 aa16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 STOX1Q6ZVD7 989 aa16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 AK7Q96M32 723 aa16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 TM6SF1Q9BZW5 370 aa16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 NARFQ9UHQ1 456 aa16.16■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 FGFR2P21802 821 aa16.15■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 SLC51AQ86UW1 340 aa16.15■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 HELLSQ9NRZ9 838 aa16.15■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 RFX7Q2KHR2 1363 aa16.15■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 MROH5Q6ZUA9 1318 aa16.15■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 BCAMP50895 628 aa16.15■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 CHRNDQ07001 517 aa16.15■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 LPIN2Q92539 896 aa16.15■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 TRIM34Q9BYJ4 488 aa16.15■□□□□ 0.18
GPC1-208ENST00000469694 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
GPC1-208ENST00000469694 SETDB2Q96T68 719 aa16.14■□□□□ 0.17
GPC1-208ENST00000469694 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
GPC1-208ENST00000469694 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
GPC1-208ENST00000469694 ATRNO75882 1429 aa16.14■□□□□ 0.17
GPC1-208ENST00000469694 FOXP2O15409 715 aa16.14■□□□□ 0.17
GPC1-208ENST00000469694 SKILP12757 684 aa16.14■□□□□ 0.17
GPC1-208ENST00000469694 STK3Q13188 491 aa16.14■□□□□ 0.17
GPC1-208ENST00000469694 ARID5BQ14865 1188 aa16.14■□□□□ 0.17
GPC1-208ENST00000469694 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa16.14■□□□□ 0.17
GPC1-208ENST00000469694 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms